Badanie markerów metabolitów w adjuwantowym raku piersi (EMMEEA)

Rak piersi składa się z wielu jednostek biologicznych. Niedawny postęp w biologii molekularnej, chip DNA lub RNA, pozwolił na globalne badanie genomu guza lub transkryptomu. Techniki te prowadzą do wzrostu wiedzy z zakresu biologii molekularnej i lepszego zrozumienia onkogenezy. Taksonomia raka piersi została ustalona na podstawie profilu genetycznego nowotworu. Ponadto klasyfikacja ta jest niepełna i nie obejmuje szlaków metabolicznych innych niż szlaki hormonalne lub HER2.

Metabolomika to rozwijająca się dziedzina badań badająca metabolity w komórkach, tkankach lub płynach biologicznych. Pozwala ocenić zmienność aktywacji różnych komórkowych szlaków metabolicznych. W onkologii może uwypuklić główne zaburzenia metaboliczne, interakcje komórek nowotworowych oraz zidentyfikować szlaki metaboliczne zaangażowane w onkogenezę za pomocą profili metabolitów komórek nowotworowych.

W porównaniu z genomiką, metabolomika zintegrowała wpływ środowisk komórkowych na biologię komórki. Środowisko komórki odgrywa bowiem kluczową rolę w onkogenezie i fenotypach komórek nowotworowych. Metabolomika, będąca więc komplementarnym podejściem do genomiki w celu oceny lepszego poznania wpływu środowiska pozakomórkowego na fenotyp komórek nowotworowych. Ponadto analizy metabolomiczne są szybkie i niedrogie, zgodne z rutynową praktyką.

Głównym celem tego badania jest podkreślenie zmiany metabolicznej specyficznej dla niektórych fenotypów nowotworów, aby lepiej zrozumieć biologię licznych jednostek raka piersi i znaleźć niektóre biomarkery, które mogą być potencjalnym celem terapeutycznym. Za pomocą spektrometru mas o wysokiej rozdzielczości badacze przeanalizują 52 próbki guza z zamrożonych próbek chirurgicznych piersi zachowanych w banku guzów Centre Antoine lacassagne. Analiza tkanki może być powiązana z analizą próbki surowicy z banku zamrożonej surowicy Centrum Antoine Lacassagne. Z 30 pacjentami, którzy wykonali 18 FDG-PET przed operacją, badacze przeanalizują korelację między nowotworową aktywacją szlaków glikolizy, oznaczoną ilościowo za pomocą spektroskopii mas, a wychwytem 18FDG. Korzystając z 17 dostępnych zamrożonych surowic, badacze przeprowadzą badanie przesiewowe w celu zidentyfikowania niektórych metabolitów lub profili metabolitów, które można wykryć w surowicy, w celu opracowania nowego podejścia do płynnej biopsji. Niniejsze badanie jest badaniem retrospektywnym opartym na danych i próbkach już dostępnych w ośrodku i zebranych podczas rutynowej praktyki.