Tutkimus aineenvaihduntamarkkereista rintasyövän adjuvantissa (EMMEEA)

Rintasyöpä koostuu useista biologisista kokonaisuuksista. Viimeaikainen edistyminen molekyylibiologiassa, DNA- tai RNA-sirussa mahdollisti maailmanlaajuisen kasvaimen genomin tai transkriptitutkimuksen. Nämä tekniikat johtavat lisääntyneeseen molekyylibiologian tietämykseen ja parempaan onkogeneesin ymmärtämiseen. Rintasyövän taksonomia perustettiin kasvaimen geneettisen profiilin perusteella. Lisäksi tämä luokitus on epätäydellinen, eikä se sisältänyt muita aineenvaihduntareittejä kuin hormonaalisia tai HER2-reittejä.

Metabolomiikka on laajeneva tutkimusala, joka tutkii soluissa, kudoksissa tai biologisissa nesteissä olevia metaboliitteja. Sen avulla voidaan arvioida eri solujen aineenvaihduntareittien variaatioaktivaatiota. Onkologiassa se voisi tuoda esiin tärkeimmät aineenvaihduntahäiriöt, kasvainsolujen vuorovaikutuksen ja tunnistaa onkogeneesiin osallistuvia aineenvaihduntareittejä kasvainsolujen metaboliittiprofiilien avulla.

Genomiin verrattuna metabolomiikka integroi soluympäristöjen vaikutuksen solubiologiaan. Soluympäristöllä on itse asiassa keskeinen rooli onkogeneesissä ja kasvainsolujen fenotyypeissä. Metabolomiikka, joka on siten täydentävä lähestymistapa genomiin, jotta voidaan arvioida parempaa tietoa solunulkoisen ympäristön vaikutuksesta kasvainsolun fenotyyppiin. Lisäksi metabolomiikka-analyysit ovat nopeita eivätkä kalliita rutiinikäytäntöjen kanssa yhteensopivia.

Tämän tutkimuksen päätavoitteena on tuoda esiin tietyille kasvainfenotyypeille spesifinen metabolinen muutos, jotta saataisiin parempi käsitys lukuisten rintasyöpäolioiden biologiasta ja löydettäisiin biomarkkereita, jotka voisivat olla mahdollinen terapeuttinen kohde. Käyttämällä korkearesoluutioista massaspektrometriä tutkijat analysoivat 52 kasvainnäytettä jäädytetystä rintakirurgisesta näytteestä, jotka on säilytetty Center Antoine lacassagne -kasvainpankissa. Kudosanalyysi voidaan yhdistää Antoine Lacassagnen keskustan jäädytetystä seerumipankista otettuun seeruminäyteanalyysiin. 30 potilaalla, jotka suorittivat 18 FDG-PET:n ennen leikkausta. Tutkijat analysoivat korrelaation glykolyysireittien kasvaimen aktivoitumisen, kvantifioitu massaspektroskopialla, ja 18FDG:n oton välillä. Käytettävissä olevien 17 pakastetun seerumin avulla tutkijat suorittavat seulonnan tunnistaakseen jotkin aineenvaihduntatuotteet tai metaboliittiprofiilit, jotka voidaan havaita seerumista, jotta voidaan kehittää uusi nestebiopsiamenetelmä. Tämä tutkimus on retrospektiivinen tutkimus, joka perustuu keskuksessa jo saatavilla oleviin ja rutiiniharjoittelun aikana kerättyihin tietoihin ja otokseen.