Studie metabolických markerů u adjuvantní rakoviny prsu (EMMEEA)

Rakovina prsu se skládá z mnoha biologických entit. Nedávný pokrok v molekulární biologii, DNA nebo RNA čip, umožnil globální genom nádoru nebo studium transkriptomu. Tyto techniky vedou ke zvýšení znalostí molekulární biologie a lepšímu pochopení onkogeneze. Taxonomie rakoviny prsu byla stanovena podle genetického profilu nádoru. Tato klasifikace je navíc neúplná a nezahrnuje jiné metabolické dráhy než hormonální nebo HER2.

Metabolomika je rozšiřující se pole výzkumu zkoumajícího metabolity v buňkách, tkáních nebo biologických tekutinách. Umožňuje posoudit variační aktivaci různých buněčných metabolických drah. V onkologii by mohla poukázat na hlavní metabolické poruchy, interakci nádorových buněk a identifikovat metabolické dráhy zapojené do onkogeneze pomocí profilů metabolitů nádorových buněk.

Ve srovnání s genomickou, metabolomika integrovala dopad buněčného prostředí na buněčnou biologii. Buněčné prostředí hraje ve skutečnosti klíčovou roli v onkogenezi a ve fenotypech nádorových buněk. Metabolomika je tedy komplementárním přístupem genomiky za účelem posouzení lepší znalosti vlivu extracelulárního prostředí na fenotyp nádorové buňky. Metabolomické analýzy jsou navíc rychlé a nenákladné kompatibilní s rutinní praxí.

Hlavním cílem této studie je poukázat na metabolické změny specifické pro určité fenotypy nádorů, abychom lépe porozuměli biologii četných entit rakoviny prsu a našli některé biomarkery, které by mohly být možným terapeutickým cílem. Pomocí hmotnostního spektrometru s vysokým rozlišením budou vyšetřovatelé analyzovat 52 vzorků nádorů ze zmrazeného chirurgického vzorku prsu uchovávaného v tumorové bance Center Antoine lacassagne. Analýza tkáně by mohla být spojena s analýzou vzorku séra z banky zmrazeného séra Centra Antoine Lacassagne. U 30 pacientů, kteří před operací provedli 18 FDG-PET, budou vyšetřovatelé analyzovat korelaci mezi nádorovou aktivací cest glykolýzy, kvantifikovanou pomocí hmotnostní spektroskopie a absorpcí 18FDG. Za použití 17 dostupných zmrazených sér provedou výzkumníci screening k identifikaci některých metabolitů nebo profilu metabolitů, které by mohly být detekovány v séru, aby vyvinuli nový přístup k tekuté biopsii. Tato studie je retrospektivní studií založenou na datech a vzorku již dostupných v centru a shromážděných během rutinní praxe.