Opracowanie i analiza banku stolca dla pacjentów z rakiem

Coraz więcej dowodów wskazuje, że skład mikrobiomu jelitowego może wpływać na skuteczność leków przeciwnowotworowych. Na przykład niedawno wykazano, że obecność pewnych drobnoustrojów w jelitach jest skorelowana z lepszą reakcją na nowe leki immunoterapeutyczne znane jako inhibitory punktów kontrolnych. Zapewnienie tych konkretnych drobnoustrojów jako terapii skojarzonej może być sposobem na poprawę ogólnego wskaźnika skuteczności tych leków. Jednak obecnie niewiele wiadomo na temat mechanizmów zaangażowanych w obserwowane pozytywne efekty.

Aby systematycznie identyfikować, w jaki sposób obecność lub brak określonych drobnoustrojów moduluje reakcję na inhibitory punktów kontrolnych i inne leki immunoterapeutyczne, Persephone Biome buduje biobank składający się z oddanych próbek od różnych pacjentów z rakiem poddawanych różnym terapiom przeciwnowotworowym. Próbki te zostaną przeanalizowane przy użyciu modeli metabolicznych i metod uczenia maszynowego w celu zidentyfikowania gatunków drobnoustrojów, funkcji genów i szlaków metabolicznych, które są związane ze skutecznością i toksycznością leczenia. Ostatecznie dane te ułatwią rozwój żywych bioterapeutyków jako terapii skojarzonych z różnymi lekami przeciwnowotworowymi.

Jest to nieinterwencyjne, dwuośrodkowe badanie z udziałem 100 pacjentów poddawanych immunoterapii nowotworów. Preferowane jest, aby rekrutacja była zrównoważona płcią; nie jest to jednak wymagane. Osoby, które spełniają kryteria wstępne, pobiorą po 5 próbek krwi, moczu i kału w okresie 12 miesięcy.

Podczas wizyty przesiewowej badani otrzymają zestaw do pobierania próbek kału oraz instrukcje, jak i kiedy pobrać próbkę kału.

Przed Wizytą 2 pacjenci pobiorą próbkę kału i zwrócą ją do laboratorium wraz z dostarczonym materiałem transportowym. Podczas wizyty 2 pacjentom zostanie pobrana krew i mocz. Zostanie wydany zestaw do pobierania próbek kału z instrukcją, jak i kiedy pobrać próbkę kału. Wizyta 2 musi być przeprowadzona przed rozpoczęciem immunoterapii.

Przed Wizytą 3 uczestnicy pobiorą próbkę kału i zwrócą ją do laboratorium wraz z dostarczonym materiałem transportowym. Podczas wizyty 3 pacjentom zostanie pobrana krew i mocz. Zostanie wydany zestaw do pobierania próbek kału z instrukcją, jak i kiedy pobrać próbkę kału.

Przed Wizytą 4 uczestnicy pobiorą próbkę kału i zwrócą ją do laboratorium wraz z dostarczonym materiałem transportowym. Podczas wizyty 4 pacjentom zostanie pobrana krew i mocz. Zostanie wydany zestaw do pobierania próbek kału z instrukcją, jak i kiedy pobrać próbkę kału.

Przed Wizytą 5 uczestnicy pobiorą próbkę kału i zwrócą ją do laboratorium wraz z dostarczonym materiałem transportowym. Podczas wizyty 5 pacjentom zostanie pobrana krew i mocz. Zostanie wydany zestaw do pobierania próbek kału z instrukcją, jak i kiedy pobrać próbkę kału.

Przed Wizytą 6 uczestnicy pobiorą próbkę kału i zwrócą ją do laboratorium wraz z dostarczonym materiałem wysyłkowym. Podczas Wizyty 6 pacjentom zostanie pobrana krew i mocz.

Wszystkie towarzyszące leki i zdarzenia niepożądane będą rejestrowane. W przypadku wystąpienia zdarzenia niepożądanego należy dołożyć wszelkich starań w celu pobrania próbek kału, krwi i moczu (traktowane jako wizyta nieplanowana).

W przypadku, gdy pacjent przerwie badanie przed wizytą 12-miesięczną (Wizyta 6), należy dołożyć wszelkich starań, aby przeprowadzić oceny dla tej wizyty. Wizyta 6 będzie jednocześnie zakończeniem wizyty studyjnej.

Każdy podmiot jest identyfikowany za pomocą unikalnego centralnego kodu identyfikacyjnego, który jest unikalny dla ośrodka badawczego. Ten kod jest używany wyłącznie do celów edukacyjnych. Po uzyskaniu świadomej zgody, każda osoba otrzyma numer podmiotu. Kod podmiotu składa się z kodu badania nieinterwencyjnego (NIS), po którym następuje kod kraju Międzynarodowej Organizacji Normalizacyjnej (ISO) oraz numer podmiotu. W czasie trwania badania i po jego zakończeniu tylko lekarz uczestnika będzie w stanie zidentyfikować uczestnika na podstawie kodu identyfikacyjnego uczestnika.

Dane pacjenta, które mają być rejestrowane w elektronicznym formularzu opisu przypadku (eCRF), obejmują dane demograficzne, historię medyczną, historię raka, historię palenia tytoniu i alkoholu, dietę, wcześniejsze i towarzyszące leki, zdarzenia niepożądane oraz wyniki skanów guza przy użyciu kryteriów oceny odpowiedzi w litych Kryteria dotyczące nowotworów (iRECIST).

Przeszkolony personel ośrodka badacza wprowadzi dane wymagane przez protokół do eCRF z dokumentów źródłowych (np. dokumentacji medycznej i narzędzi do przechwytywania danych specyficznych dla danego badania, jeśli to konieczne) bezpośrednio do bazy danych badania na serwerze centralnym. Wszystkie informacje w eCRF muszą być identyfikowalne z tymi dokumentami źródłowymi. Dane zapisane bezpośrednio w eCRF zostaną zdefiniowane przed rozpoczęciem badania, a eCRF będą uważane za dane źródłowe. Współpracownicy ds. badań klinicznych (CRA) i kierownik ds. danych dokonają przeglądu eCRF wprowadzonych przez personel badawczy pod kątem kompletności i dokładności. Automatyczne programy jakości sprawdzają rozbieżności danych w eCRF, a wynikające z nich zapytania zostaną przekazane do ośrodka badawczego za pomocą procesu elektronicznego zapytania o dane w systemie elektronicznego przechwytywania danych (EDC). Wyznaczony personel ośrodka prowadzącego badanie jest zobowiązany odpowiadać na zapytania i wprowadzać wszelkie niezbędne zmiany w danych. Szczegóły procesu poprawiania danych zostaną określone w Planie zarządzania danymi. Wykorzystana zostanie zweryfikowana, elektroniczna baza danych z systemu EDC. Ścieżka audytu wszystkich zmian w tej bazie danych, w tym data, przyczyna zmiany danych i kto dokonał zmiany, będzie prowadzona w tej samej bazie danych. Ścieżka audytu będzie częścią zarchiwizowanych danych na koniec badania.

Cały proces zarządzania danymi (przechwytywanie danych, wprowadzanie danych, walidacja danych, sprawdzanie wiarygodności, obsługa zapytań, edycja danych po wprowadzeniu, kodowanie, zamknięcie bazy danych itp.) zostanie z góry zdefiniowany w ramach planu zarządzania danymi.

Automatyczne zapytania zostaną zdefiniowane zgodnie z planem zarządzania danymi. Zapytania te będą automatycznie generowane w systemie EDC w celu korekty i dokładności danych. Korekty zostaną wprowadzone bezpośrednio do systemu. Ta procedura będzie powtarzana, aż wszystkie zapytania zostaną rozwiązane.

Sponsor przeprowadzi wizytę na miejscu w celu zweryfikowania kwalifikacji każdego badacza, inspekcji obiektów na miejscu oraz poinformowania badacza o obowiązkach i procedurach zapewnienia odpowiedniej i prawidłowej dokumentacji. Od badacza wymaga się przygotowania i prowadzenia odpowiednich i dokładnych historii przypadków, mających na celu rejestrowanie wszystkich obserwacji i innych danych dotyczących badania każdego uczestnika. Wszystkie informacje zapisane w eCRF dla tego badania muszą być zgodne z dokumentacją źródłową uczestników (tj. dokumentacją medyczną).