Utveckling och analys av en pallbank för cancerpatienter

En växande mängd bevis tyder på att sammansättningen av tarmmikrobiomet kan påverka effekten av cancerläkemedel. Till exempel har det nyligen visat sig att förekomsten av vissa mikrober i tarmen är korrelerad med bättre känslighet för de nya immunterapiläkemedlen som kallas checkpoint-hämmare. Att tillhandahålla dessa speciella mikrober som en samterapi kan vara ett sätt att förbättra den totala framgångsfrekvensen för dessa läkemedel. Men för närvarande är mycket lite känt om mekanismerna som är involverade i dessa observerade positiva effekter.

För att systematiskt identifiera hur närvaron eller frånvaron av särskilda mikrober modulerar känsligheten för checkpoint-hämmare och andra immunterapiläkemedel, bygger Persephone Biome en biobank som består av donerade prover från en mångfald cancerpatienter som genomgår olika anti-cancerbehandlingar. Dessa prover kommer att analyseras med hjälp av metaboliska modeller och metoder för maskininlärning för att identifiera mikrobiella arter, genfunktioner och metaboliska vägar som är associerade med behandlingars effektivitet och toxicitet. I slutändan kommer dessa data att underlätta utvecklingen av levande bioterapeutika som samterapier till olika cancerläkemedel.

Detta är en icke-interventionsstudie med två platser på 100 försökspersoner som genomgår någon typ av cancerimmunterapi. Det är att föredra att inskrivningen är balanserad efter kön; det krävs dock inte. Försökspersoner som uppfyller inträdeskriterierna kommer att ge 5 prover vardera av blod, urin och avföring under en 12-månadersperiod.

Under screeningbesöket kommer försökspersonerna att få ett avföringsprovtagningskit och instruktioner om hur och när de ska ta avföringsprovet.

Före besök 2 kommer försökspersonerna att samla ett avföringsprov och returnera det till laboratoriet med det medföljande fraktmaterialet. Vid besöket kommer 2 försökspersoner att få blod och urin samlas upp. Ett avföringsprovtagningskit kommer att tillhandahållas med instruktioner om hur och när avföringsprovet ska samlas in. Besök 2 måste genomföras innan immunterapi påbörjas.

Före besök 3 kommer försökspersonerna att samla ett avföringsprov och returnera det till laboratoriet med det medföljande fraktmaterialet. Vid besöket kommer 3 försökspersoner att få blod och urin samlas upp. Ett avföringsprovtagningskit kommer att tillhandahållas med instruktioner om hur och när avföringsprovet ska samlas in.

Före besök 4 kommer försökspersonerna att samla ett avföringsprov och returnera det till laboratoriet med det medföljande fraktmaterialet. Vid besöket kommer 4 försökspersoner att få blod och urin samlas upp. Ett avföringsprovtagningskit kommer att tillhandahållas med instruktioner om hur och när avföringsprovet ska samlas in.

Före besök 5 kommer försökspersonerna att samla ett avföringsprov och returnera det till laboratoriet med det medföljande fraktmaterialet. Vid besöket kommer 5 försökspersoner att få blod och urin samlas upp. Ett avföringsprovtagningskit kommer att tillhandahållas med instruktioner om hur och när avföringsprovet ska samlas in.

Före besök 6 kommer försökspersonerna att samla ett avföringsprov och returnera det till laboratoriet med det medföljande fraktmaterialet. Vid besöket kommer 6 försökspersoner att få blod och urin samlas upp.

Alla samtidiga mediciner och biverkningar kommer att registreras. I händelse av en oönskad händelse bör alla ansträngningar göras för att samla avförings-, blod- och urinprover (som betraktas som ett oplanerat besök).

I händelse av att en försöksperson avbryter studien före det 12 månader långa besöket (besök 6) bör alla ansträngningar göras för att genomföra bedömningarna för det besöket. Besök 6 kommer också att fungera som avslutning på studiebesöket.

Varje ämne identifieras med en unik central identifieringskod som är unik för studieplatsen. Denna kod används endast för studieändamål. Efter informerat samtycke kommer varje person att få ett ämnesnummer. Ämneskoden består av en NIS-kod (non interventional study) följt av en landskod för International Organization for Standardization (ISO) och ämnesnumret. Under hela studien och efteråt kommer endast försökspersonens läkare att kunna identifiera försökspersonen baserat på försökspersonens identifieringskod.

Patientdata som ska fångas in i det elektroniska fallrapportformuläret (eCRF) inkluderar demografi, medicinsk historia, cancerhistoria, tobaks- och alkoholhistoria, kost, tidigare och samtidig medicinering, biverkningar och resultat av tumörskanningar med användning av Response Evaluation Criteria in Solid Tumörkriterier (iRECIST).

Den utbildade personalen på utredarplatsen kommer att mata in de data som krävs av protokollet i eCRF från källdokument (t.ex. medicinska journaler och studiespecifika datainsamlingsverktyg efter behov) direkt i studiedatabasen på en central server. All information i eCRF:erna måste kunna spåras till dessa källdokument. Data som registreras direkt i eCRF kommer att definieras före studiestart och eCRF kommer att betraktas som källdata. Clinical Research Associates (CRA) och en datahanterare kommer att granska eCRF:er som angetts av undersökningspersonal för fullständighet och noggrannhet. Automatiska kvalitetsprogram kontrollerar dataavvikelser i eCRF:erna och de resulterande frågorna kommer att meddelas till undersökningsplatsen med hjälp av en elektronisk dataförfrågningsprocess inom systemet för elektronisk datainsamling (EDC). Utsedda utredarplatspersonal måste svara på frågor och göra nödvändiga ändringar av uppgifterna. Detaljer om datakorrigeringsprocessen kommer att specificeras i datahanteringsplanen. En validerad elektronisk databas kommer att användas från EDC-systemet. En granskning av alla ändringar i denna databas, inklusive datum, orsak till dataändringen och vem som gjorde ändringen, kommer att upprätthållas i samma databas. Granskningsspåret kommer att vara en del av de arkiverade uppgifterna i slutet av studien.

Den fullständiga datahanteringsprocessen (datainsamling, datainmatning, datavalidering, kontroller av rimlighet, frågehantering, dataredigering efter inmatning, kodning, stängning av databas, etc.) kommer att definieras i förväg inom en datahanteringsplan.

Automatiska frågor kommer att definieras enligt datahanteringsplanen. Dessa frågor kommer att genereras automatiskt i EDC-systemet för datakorrigering och noggrannhet. Rättelser kommer att föras in direkt i systemet. Denna procedur kommer att upprepas tills alla frågor är lösta.

Sponsorn kommer att genomföra ett besök på plats för att verifiera varje utredares kvalifikationer, inspektera platsanläggningarna och informera utredaren om ansvar och förfaranden för att säkerställa adekvat och korrekt dokumentation. Utredaren måste förbereda och underhålla adekvata och korrekta fallhistorier utformade för att registrera alla observationer och andra data som är relevanta för studien för varje studiedeltagare. All information som registreras på eCRF för denna studie måste överensstämma med försökspersonernas källdokumentation (d.v.s. medicinska journaler).