Vývoj a analýza stolice pro pacienty s rakovinou

Rostoucí množství důkazů naznačuje, že složení střevního mikrobiomu může ovlivnit účinnost léků proti rakovině. Nedávno bylo například prokázáno, že přítomnost určitých mikrobů ve střevě koreluje s lepší odezvou na nová imunoterapeutická léčiva známá jako inhibitory kontrolních bodů. Poskytování těchto konkrétních mikrobů jako koterapie může být způsobem, jak zlepšit celkovou úspěšnost těchto léků. V současnosti je však známo velmi málo o mechanismech, které se podílejí na těchto pozorovaných pozitivních účincích.

Aby bylo možné systematicky identifikovat, jak přítomnost nebo nepřítomnost konkrétních mikrobů moduluje odezvu na inhibitory kontrolních bodů a další imunoterapeutická léčiva, Persephone Biome buduje biobanku složenou z darovaných vzorků od různých pacientů s rakovinou, kteří podstupují různé protirakovinné léčby. Tyto vzorky budou analyzovány pomocí metabolických modelů a přístupů strojového učení k identifikaci mikrobiálních druhů, genových funkcí a metabolických drah, které jsou spojeny s účinností a toxicitou léčby. V konečném důsledku tato data usnadní vývoj živých bioterapeutik jako společných terapií k různým lékům proti rakovině.

Toto je neintervenční studie na dvou místech u 100 subjektů, které podstupují jakýkoli typ imunoterapie rakoviny. Je preferováno, aby byl zápis vyvážen podle pohlaví; není to však vyžadováno. Subjekty, které splňují vstupní kritéria, poskytnou 5 vzorků krve, moči a stolice po dobu 12 měsíců.

Během screeningové návštěvy subjekty obdrží soupravu pro odběr vzorků stolice a instrukce, jak a kdy odebrat vzorek stolice.

Před návštěvou 2 subjekty odeberou vzorek stolice a vrátí jej do laboratoře s poskytnutým přepravním materiálem. Při návštěvě 2 bude subjektům odebrána krev a odebrána moč. Sada pro odběr vzorků stolice bude vydána s pokyny, jak a kdy odebrat vzorek stolice. Návštěva 2 musí být provedena před zahájením imunoterapie.

Před návštěvou 3 subjekty odeberou vzorek stolice a vrátí jej do laboratoře s poskytnutým přepravním materiálem. Při návštěvě 3 bude subjektům odebrána krev a odebrána moč. Sada pro odběr vzorků stolice bude vydána s pokyny, jak a kdy odebrat vzorek stolice.

Před návštěvou 4 si subjekty odeberou vzorek stolice a vrátí jej do laboratoře s poskytnutým přepravním materiálem. Při návštěvě 4 bude subjektům odebrána krev a odebrána moč. Sada pro odběr vzorků stolice bude vydána s pokyny, jak a kdy odebrat vzorek stolice.

Před návštěvou 5 si subjekty odeberou vzorek stolice a vrátí jej do laboratoře s poskytnutým přepravním materiálem. Při návštěvě 5 bude subjektům odebrána krev a odebrána moč. Sada pro odběr vzorků stolice bude vydána s pokyny, jak a kdy odebrat vzorek stolice.

Před návštěvou 6 si subjekty odeberou vzorek stolice a vrátí jej do laboratoře s poskytnutým přepravním materiálem. Při návštěvě 6 bude subjektům odebrána krev a odebrána moč.

Všechny souběžně užívané léky a nežádoucí účinky budou zaznamenány. V případě nežádoucí příhody je třeba vyvinout maximální úsilí k odběru vzorků stolice, krve a moči (považuje se za neplánovanou návštěvu).

V případě, že subjekt přeruší studii před 12měsíční návštěvou (návštěva 6), mělo by být vynaloženo veškeré úsilí k provedení hodnocení pro tuto návštěvu. Návštěva 6 bude zároveň sloužit jako ukončení studijní návštěvy.

Každý subjekt je identifikován jedinečným centrálním identifikačním kódem, který je jedinečný pro místo studie. Tento kód se používá pouze pro studijní účely. Po informovaném souhlasu bude každé osobě přiděleno číslo subjektu. Kód předmětu se skládá z kódu neintervenční studie (NIS), za nímž následuje kód země Mezinárodní organizace pro standardizaci (ISO) a číslo předmětu. Po dobu trvání studie a poté bude pouze lékař subjektu schopen identifikovat subjekt na základě identifikačního kódu subjektu.

Údaje o pacientech, které mají být zachyceny v elektronickém formuláři kazuistiky (eCRF), zahrnují demografické údaje, lékařskou anamnézu, anamnézu rakoviny, tabákovou a alkoholovou anamnézu, dietu, předchozí a souběžné léky, nežádoucí příhody a výsledky skenování nádorů pomocí kritérií hodnocení odpovědi v pevném stavu. Kritéria pro nádory (iRECIST).

Vyškolený personál pracoviště zkoušejícího vloží data požadovaná protokolem do eCRF ze zdrojových dokumentů (např. lékařských záznamů a nástrojů pro sběr dat specifických pro studii podle potřeby) přímo do databáze studie na centrálním serveru. Všechny informace v eCRF musí být vysledovatelné k těmto zdrojovým dokumentům. Data zaznamenaná přímo do eCRF budou definována před zahájením studie a eCRF budou považovány za zdrojová data. Společnosti Clinical Research Associates (CRA) a správce dat zkontrolují úplnost a přesnost eCRF zadaných výzkumným personálem. Automatické programy kvality kontrolují nesrovnalosti v datech v eCRF a výsledné dotazy budou oznámeny vyšetřovacímu místu pomocí procesu elektronického dotazování na data v rámci systému Electronic Data Capture (EDC). Pověření pracovníci pracoviště zkoušejícího jsou povinni odpovídat na dotazy a provádět nezbytné změny v datech. Podrobnosti procesu opravy dat budou uvedeny v plánu správy dat. Ze systému EDC bude použita ověřená elektronická databáze. Auditní záznam všech změn v této databázi, včetně data, důvodu změny údajů a toho, kdo změnu provedl, bude uchováván ve stejné databázi. Auditní stopa bude součástí archivovaných dat na konci studie.

Kompletní proces správy dat (sběr dat, zadávání dat, validace dat, kontrola věrohodnosti, zpracování dotazů, editace dat po zadání, kódování, uzavření databáze atd.) bude předem definován v rámci plánu správy dat.

Automatické dotazy budou definovány podle plánu správy dat. Tyto dotazy budou automaticky generovány v systému EDC pro opravu a přesnost dat. Opravy budou zadávány přímo do systému. Tento postup se bude opakovat, dokud nebudou vyřešeny všechny dotazy.

Sponzor provede návštěvu na místě, aby ověřil kvalifikaci každého zkoušejícího, zkontroloval zařízení místa a informoval zkoušejícího o povinnostech a postupech pro zajištění přiměřené a správné dokumentace. Od zkoušejícího se požaduje, aby připravil a vedl adekvátní a přesné anamnézy případů navržené tak, aby zaznamenával všechna pozorování a další údaje týkající se studie pro každého účastníka studie. Všechny informace zaznamenané v eCRF pro tuto studii musí být v souladu se zdrojovou dokumentací subjektů (tj. lékařskými záznamy).