Sequenciamento de Próxima Geração de Tecidos Normais Prospectivamente em Pacientes Oncológicos Pediátricos

O desenvolvimento de técnicas de sequenciamento de próxima geração (NGS), incluindo genoma completo (WGS), exoma (WES) e sequenciamento de RNA revolucionou a capacidade dos investigadores de questionar os mecanismos moleculares subjacentes à formação do tumor. Por meio do Projeto do Genoma do Câncer Pediátrico (PCGP), os pesquisadores do St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH) usaram com sucesso abordagens NGS para avaliar mais de 1.000 cânceres pediátricos, desde malignidades hematológicas até tumores sólidos do sistema nervoso central (SNC) e não SNC . A partir desses e de estudos relacionados, ficou claro que as abordagens genômicas podem classificar com precisão os tumores em subtipos patológicos e prognósticos distintos e detectar alterações nas vias celulares que podem servir como novos alvos terapêuticos. Coletivamente, esses estudos sugerem que, ao caracterizar a composição genômica de tumores individuais, os investigadores poderão desenvolver tratamentos de câncer personalizados e potencialmente mais eficazes e/ou medidas preventivas.

Este protocolo foi inicialmente promulgado para introduzir as abordagens NGS nos cuidados clínicos de rotina. Durante a fase inicial do protocolo G4K, 310 participantes foram recrutados e incluídos no estudo. O sequenciamento de tumores e/ou linha germinativa foi concluído em todos os 310 pacientes, com 253 relatórios somáticos gerados (representando 96% dos 263 participantes para os quais o tecido tumoral estava disponível e analisado) e 301 relatórios de linha germinativa gerados (100% dos 301 participantes que concordaram em o recebimento dos resultados da linha germinal). As análises dos dados do estudo estão em andamento com planos para preparar manuscritos iniciais nos próximos meses. Devido à execução inicial bem-sucedida do protocolo G4K, o sequenciamento genômico clínico de amostras de tumor e linhagem germinativa agora é oferecido como parte do atendimento clínico padrão para pacientes oncológicos pediátricos no St. Jude.

O protocolo G4K foi revisado. Com a revisão, a equipe do estudo registrará, armazenará e analisará as informações genômicas da linhagem germinativa e do tumor. Por meio da coleta desses dados, examinaremos como as mutações germinativas em 150 genes de predisposição ao câncer influenciam a apresentação clínica, a histologia do tumor, os achados genômicos do tumor, a resposta à terapia e os resultados a longo prazo. Os objetivos gerais desta pesquisa são definir ainda mais a prevalência, o espectro e a herdabilidade das variantes da linhagem germinativa nesses genes e decifrar como as mutações da linhagem germinativa influenciam os fenótipos de uma gama crescente de síndromes de predisposição ao câncer. Esses estudos nos permitem fornecer aconselhamento genético e estratégias de gerenciamento mais precisas para futuras crianças com mutações nesses genes.

Este continua sendo um estudo não terapêutico. Os investigadores antecipam um tamanho de amostra de aproximadamente 5.000 pacientes que serão recrutados nos próximos 7 anos.