Идентификация возбудителя бактериальной пневмонии с помощью обнаружения ДНК

Образцы мокроты, обычно собираемые у пациентов с пневмонией для рутинного микробиологического исследования, и дополнительные образцы будут оцениваться с помощью анализа ядерной кислоты, разработанного в нашей лаборатории. Анализ будет направлен на различные патогены, включая Streptococcus pneumoniae, Hemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter, Mycoplasma pneumonia, Chlamydia pneumoniae и Legionella pneumophila, а также на распространенные гены устойчивости к антибиотикам, такие как гены БЛРС, МекА, ОпрД. Конечная цель состоит в том, чтобы иметь доступную панель высокоточного и быстрого (в тот же день) анализа, который будет проведен в течение нескольких часов для идентификации.

Извлеченная нуклеиновая кислота патогена в образце мокроты будет идентифицирована с помощью анализа обнаружения нуклеиновой кислоты с помощью микрофлюидного чипа и методов LAMP. Виды бактерий и их ген устойчивости к антибиотикам, подлежащие обнаружению, перечислены выше. Поскольку экстракты нуклеиновых кислот будут храниться в архиве, в будущем можно будет исследовать другие патогены, если будет разработан соответствующий анализ. Все результаты, полученные при обнаружении ядерной кислоты, будут сравниваться с результатами обычных испытаний, перечисленных выше. Будут рассчитаны чувствительность, специфичность и прогностические значения. В случаях, когда возникают противоречивые результаты, должным образом проводятся дополнительные анализы и/или анализ истории болезни.