Patogenidentifikation af bakteriel lungebetændelse via DNA-detektion

Sputumprøver, der normalt indsamles fra patienter med lungebetændelse til rutinemæssig mikrobiologisk testning og ekstra prøver, vil blive evalueret via nuklearsyreassay udviklet i vores laboratorium. Assayet vil være rettet mod en række af begge patogener, herunder Streptococcus pneumoniae, Hemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, såsom pneumoniae og Legionella-gener, ESB-gener, pneumoniae og Legionellas. s, MecA, OprD. Det ultimative mål er at have et tilgængeligt panel af meget nøjagtige og hurtige (samme dag) assays, som vil blive udført på flere timer til identifikation.

Den ekstraherede patogennukleinsyre i sputumprøven vil blive identificeret ved nuklearsyredetektionsassay med Microfluidic Pumping Chip og LAMP-metoder. De bakteriearter og deres antibiotika-resistente gen, der skal påvises, er som anført ovenfor. Da nukleinsyreekstrakter vil blive arkiveret, kan andre patogener undersøges i fremtiden, hvis det korrelerede assay udvikles. Alle resultater opnået ved nuklear syredetektion vil blive sammenlignet med resultater for konventionel testning som anført ovenfor. Sensitivitet, specificitet og prædiktive værdier vil blive beregnet. I tilfælde, hvor der forekommer uoverensstemmende resultater, vil yderligere test og/eller sygehistorie blive udført korrekt.