Pathogeenidentificatie van bacteriële longontsteking via DNA-detectie

Sputumspecimens die normaal gesproken worden verzameld bij patiënten met longontsteking voor routinematig microbiologisch onderzoek en extra specimens zullen worden geëvalueerd via een in ons laboratorium ontwikkelde kernzuurassay. De test zal gericht zijn op verschillende van beide pathogenen, waaronder Streptococcus pneumoniae, Hemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter, Mycoplasma pneumonia, Chlamydia pneumoniae en Legionella pneumophila, en veelvoorkomende antibioticaresistente genen, zoals ESBL-genen, Meca, OprD. Het uiteindelijke doel is om een ​​panel van zeer nauwkeurige en snelle (dezelfde dag) assays beschikbaar te hebben, die ter identificatie binnen enkele uren zullen worden uitgevoerd.

Het geëxtraheerde pathogene nucleïnezuur in sputumspecimen zal worden geïdentificeerd door middel van een nucleair zuurdetectieassay met Microfluïdische Pumping Chip- en LAMP-methoden. De soorten bacteriën en hun te detecteren antibioticum-resistente gen zijn zoals hierboven vermeld. Omdat nucleïnezuurextracten worden gearchiveerd, kunnen andere pathogenen in de toekomst worden onderzocht als de gecorreleerde test wordt ontwikkeld. Alle resultaten verkregen door detectie van nucleair zuur zullen worden vergeleken met de resultaten van conventionele testen zoals hierboven vermeld. Gevoeligheid, specificiteit en voorspellende waarden worden berekend. In gevallen waarin tegenstrijdige resultaten optreden, zullen aanvullende tests en/of beoordeling van de medische geschiedenis naar behoren worden uitgevoerd.