Identificazione dell'agente patogeno della polmonite batterica tramite rilevamento del DNA

I campioni di espettorato normalmente raccolti dai pazienti con polmonite per i test microbiologici di routine e i campioni extra saranno valutati tramite test dell'acido nucleare sviluppato nel nostro laboratorio. Il saggio sarà diretto alla varietà di entrambi i patogeni, inclusi Streptococcus pneumoniae, Hemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter, Mycoplasma pneumonia, Chlamydia pneumoniae e Legionella pneumophila, e comuni geni resistenti agli antibiotici, come i geni ESBL, MecA, OprD. L'obiettivo finale è quello di avere a disposizione un panel di analisi altamente accurate e rapide (stesso giorno), che saranno effettuate in diverse ore per l'identificazione.

L'acido nucleico patogeno estratto nel campione di espettorato sarà identificato mediante test di rilevamento dell'acido nucleare con metodi Microfluidic Pumping Chip e LAMP. Le specie di batteri e il loro gene resistente agli antibiotici da rilevare sono elencati sopra. Poiché gli estratti di acido nucleico verranno archiviati, altri agenti patogeni potranno essere studiati in futuro se verrà sviluppato il test correlato. Tutti i risultati ottenuti dal rilevamento dell'acido nucleare saranno confrontati con i risultati dei test convenzionali come sopra elencati. Saranno calcolati sensibilità, specificità e valori predittivi. Nei casi in cui si verificano risultati discordanti, verranno eseguiti correttamente test aggiuntivi e/o revisione della storia medica.