Универсальное обнаружение одиночной молекулы амплификации в жидкой биопсии (VerSiLiB)

Надежное обнаружение отдельных молекул в сложных биологических жидкостях является конечной целью в области анализа биомаркеров заболеваний.

Традиционно, чтобы сделать возможным количественный анализ отдельных молекул в макроскопических объемах, предварительное концентрирование аналита и разделение образца на отсеки fL-nL сочетались с амплификациями специфических событий распознавания. В этих установках положительное или отрицательное обнаружение сигнала флуоресценции запускается ферментативными реакциями, происходящими в каждом отсеке.

Двоичное считывание, основанное на статистике Пуассона, дает количественную оценку сверхнизких концентраций молекул аналита. Этот подход был принят для анализа нуклеиновых кислот в текущей цифровой ПЦР, а также доступен для белков в методе, названном цифровым ИФА.

Целью VerSiLiB является разработка стратегии бесферментной амплификации для анализа как белков, так и аналитов нуклеиновых кислот с помощью единой цифровой платформы, которая предлагает средства для доступа к дополнительной информации о целевых аналитах, недостижимой с помощью современных технологий. Метод основан на новой аффинно-опосредованной транспортной амплификации, где аффинное взаимодействие целевого аналита со специфическим лигандом, присоединенным к переносчику магнитных наночастиц, сопровождается быстрым перемещением флуоресцентных индикаторов, которые служат репортерами. При приложении внешнего магнитного поля трассеры переносятся со стороны хранения трассеров (где они темные) на активную сторону трассеров (где они становятся яркими) только в том случае, если целевой аналит присутствует в небольшом реакционном отсеке. Специализированные плазмонные наноструктуры будут подготовлены на складе и на активной стороне отсека, чтобы сделать трассер либо темным, либо ярким. Цель состоит в том, чтобы выполнить проверку технологии для новой платформы амплификации протеогеномики VerSiLiB в лечении рака с использованием образцов жидкой биопсии из биобанков.