乳腺癌液体活检分层 (BALIBISTRA)

乳腺癌是奥地利女性中最常见的癌症。 预后和治疗策略的估计越来越依赖于将肿瘤分层为不同的实体或类别。 目前，肿瘤的临床常规分层主要基于激素受体、HER2状态和增殖评估。 然而，通过阐明进一步的生物学特性可以实现更稳健和客观的肿瘤分类，这也具有越来越重要的意义，因为新的抗癌疗法是基于生物学机制的。 因此，来自分子分析的可用信息越来越多地用于常规诊断分析，目的是改进分层以优化治疗选择。 迄今为止，最广泛的基于分子的乳腺癌分类学已经通过基于结合基因表达和体细胞拷贝数改变（SCNA）的分类实现，称为整合簇。 组织活检是目前实现此类分类的黄金标准。 然而，它们通常很难在转移环境中获得，并且由于肿瘤内的异质性而受到抽样偏差的影响。 除其他分析物外，“液体活检”基于对含有循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的无细胞 DNA (cfDNA) 的分析，即 在癌症患者中，DNA 片段从正常细胞和肿瘤细胞脱落到血液中。 cfDNA 可以通过抽血微创获得，允许对循环中的肿瘤 DNA 进行“实时”分析，并且可以在任何时间点重复血液样本，这对于监测对治疗的反应尤为重要。 研究小组在 cfDNA 分析方面拥有广泛的专业知识，并开发了多种 ctDNA 分析方法。 最近，研究人员开发了一种与核小体位置和基因表达相关的新方法。 cfDNA 片段与酶促处理后凋亡细胞释放 DNA 有关，因此主要由单核小体 DNA 组成。 通过对 cfDNA 进行全基因组测序，研究人员可以证明在转录起始位点，核小体占据导致表达基因和沉默基因的不同读取深度覆盖模式。 通过使用机器学习进行基因分类，研究人员能够对细胞中的基因进行分类，这些基因将其 DNA 释放到循环中。 该项目的主要假设是，可以直接从血液中建立综合乳腺癌集群，而无需进行侵入性组织活检。 因此，该研究的目标包括完善患者分层以改进治疗策略的选择。 此外，研究人员将获得对转移性乳腺癌生物学的新见解，因此该项目将对患者、临床肿瘤学家、病理学家、药理学家以及所有对癌症感兴趣的基础研究人员产生重要影响。