A mellrák folyékony biopsziás rétegződése (BALIBISTRA)
A tanulmány áttekintése
Állapot
Állapot
Körülmények
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
A kutatók 340 plazmamintát gyűjtöttek 144 klinikailag annotált betegtől, részletes klinikai adatokkal. Már minden plazmamintát elemeztek a plazma-Seq módszerrel, amely a szekvencia olvasási mélységétől méri a kópiaszámot a szomatikus kópiaszám-változások (SCNA-k) első értékeléséhez. Mivel ez a projekt megvalósíthatósági tanulmányt jelent, a kutatók azt kívánják értékelni, hogy milyen mértékben határozhatók meg a cisz-hatású változások, azaz a megfelelő génexpressziós változásokat nukleoszóma-pozíció-térképezéssel állapítják meg, ahogyan azt csoportunk korábban publikálta. Az eredményeket megerősítik a megfelelő primer tumor SCNA-seq és RNA-seq elemzése.
A 340 plazmamintából a vizsgálók 59-et választottak ki a luminális (pl. azok, amelyek 17q23, 11q13/q14, 8p12, 8q erősítéssel és 16p és 1q erősítéssel rendelkeznek; n=25), bazális (azaz. 8q, 10p, 12p erősítések és különféle erősítések a nagy genomi instabilitás miatt; n=25), és ERBB2/HER2 (azaz. magas szintű amplifikáció a 17q-n, központosítva, beleértve a HER2 gént; n=9). Ezeket a mintákat nagy lefedettséggel (70-szeres) szekvenálják, hogy a kapott szekvenciákból mind a mutációk, mind a nukleoszómapozíciók kinyerhetők legyenek.
Tanulmány típusa
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Várható)
Beiratkozás
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi helyek
-
-
-
Graz, Ausztria, 8010
- Medical University of Graz
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
A vizsgálatba olyan nőket vonnak be, akiknél emlőrák szövettanilag bizonyított, és megfelelő klinikai adatokkal rendelkezik.
A résztvevőket a grazi Orvosi Egyetemi Kórházban vették fel.
Leírás
Bevételi kritériumok:
Az emlőrák szövettani diagnózisa, a primer tumorszövet és a magas ctDNS tartalmú plazma DNS elérhetősége.
Kizárási kritériumok:
A páciens a részvételt elutasítja.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Koncepció bizonyítékaként értékelni azt a képességet, hogy a betegeket kizárólag egy részletes plazma DNS-elemzés alapján lehet rétegezni
Időkeret: Három év
|
Minden betegnél feljegyeztük a klinikai-patológiai jellemzőket, beleértve a korábbi és az azt követő terápiákat.
Minden beteg esetében standard besorolást végeztek luminális, bazális, ERBB2/HER2 kategóriába, és ez elérhető.
|
Három év
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Szponzor
Nyomozók
Nyomozók
- Kutatásvezető: Michael R Speicher, MD, Medical University of Graz
Publikációk és hasznos linkek
Általános kiadványok
- Heitzer E, Haque IS, Roberts CES, Speicher MR. Current and future perspectives of liquid biopsies in genomics-driven oncology. Nat Rev Genet. 2019 Feb;20(2):71-88. doi: 10.1038/s41576-018-0071-5.
- Ulz P, Belic J, Graf R, Auer M, Lafer I, Fischereder K, Webersinke G, Pummer K, Augustin H, Pichler M, Hoefler G, Bauernhofer T, Geigl JB, Heitzer E, Speicher MR. Whole-genome plasma sequencing reveals focal amplifications as a driving force in metastatic prostate cancer. Nat Commun. 2016 Jun 22;7:12008. doi: 10.1038/ncomms12008.
- Ulz P, Heitzer E, Speicher MR. Co-occurrence of MYC amplification and TP53 mutations in human cancer. Nat Genet. 2016 Feb;48(2):104-6. doi: 10.1038/ng.3468. No abstract available.
- Ulz P, Thallinger GG, Auer M, Graf R, Kashofer K, Jahn SW, Abete L, Pristauz G, Petru E, Geigl JB, Heitzer E, Speicher MR. Inferring expressed genes by whole-genome sequencing of plasma DNA. Nat Genet. 2016 Oct;48(10):1273-8. doi: 10.1038/ng.3648. Epub 2016 Aug 29.
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Tanulmány kezdete
Elsődleges befejezés (Várható)
Elsődleges befejezés
A tanulmány befejezése (Várható)
A tanulmány befejezése
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Első közzététel
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Utolsó frissítés közzétéve
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- BreastctDNA01
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .