分枝杆菌呼吸消化道感染的人类先天免疫反应 (UBC-INNATE01)

我们将使用的方法是利用免疫读数和基因组学来观察人类肠道受控感染挑战期间的反应模式。

基因组学使用“Affymetrix”基因阵列和其他技术来确定基因表达的概况。 当一个基因被“打开”时，它会产生 mRNA，人体将其用作制造蛋白质的模板。 我们将从感染前、感染期间和感染后的白细胞中提取所有 mRNA。 基因芯片有成百上千个微型传感器，可以测量样本中存在多少来自任何特定基因的 mRNA。 因此，我们可以开始了解在先天免疫反应发展阶段白细胞内哪些基因开启或关闭，或未受影响。 这使我们能够监测身体对感染的反应，并了解哪些基因家族在肠道感染的不同阶段很重要。

BCG疫苗来源于牛分枝杆菌（该生物体的全称是牛分枝杆菌Baccille Calmette Guérin）。 在这项研究中，我们建议使用作为预防性和治疗性口服疫苗生产的口服 BCG 制剂，作为自然肠道感染致病性牛分枝杆菌的安全模型。 BCG 等分枝杆菌的细胞壁是一种强大的免疫佐剂（佐剂是一种增强免疫反应的物质），因为细胞壁中的脂质、糖类和蛋白质与先天免疫系统的分子相互作用强烈。 因此，它提供了一种安全但高效的方法来在肠道感染的“自然”条件下刺激先天免疫。 选择第一个模型是因为它反映了“现实世界”疾病预防的高度优先领域，同时在口腔 BCG 模型中具有高水平的安全性和可重复性。

通过在受控条件下小心地向健康志愿者提供口服 BCG 挑战，我们可以减少蛋白质组学和基因组分析中的噪音和背景活动，我们将用于分析正在发展的先天免疫反应。 我们可以通过使用我们在之前的研究中开发的用于检测这些免疫反应的敏感测定来测量特定的适应性 T 细胞和抗体反应，从而检查 BCG 是否确实定植并“感染”了受试者。 这是该研究的一个关键方面：如果我们检测到 BCG 特异性 T 细胞反应，我们可以确信“感染”已经发生，因此可以解释我们在免疫学和基因组学中看到的概况。

如果我们看到免疫反应，我们可以将任何先天免疫激活与 BCG 定植联系起来。 相反，即使我们没有看到免疫反应，但可以确定疫苗以可行的配方正确输送（我们将通过遵守严格的良好临床实践来做到这一点），那么我们可以查看基因组和蛋白质组学特征在感染前的基线测量中，可以预测生物体感染失败。

通过收集并发疾病或其他不良事件等其他事件的数据，我们还可以确定蛋白质组学或基因表达谱的变化是否确实是由于模型感染或外来事件引起的。 这项初步研究将使我们能够改进昂贵的技术、协议和化验，让我们在后续研究中更专注于细节

这项研究将根据圣乔治疫苗研究所的标准操作程序 (SOP) 进行。 本研究将包括多达 10 名受试者。 该研究将包括研究前筛选访问和 23 次访问，为期 12 个月，时间在调查时间表中指定。