基于全基因组单核苷酸多态性 (SNP) 阵列的方法预测急性淋巴细胞白血病患者的化学反应和生存
急性淋巴细胞白血病(ALL)不是单一疾病,而是异质亚群的复合体。 因此,更复杂的 ALL 分类对于进一步改善治疗结果至关重要。 然而,只有少数遗传标记被揭示对 ALL 患者具有重要的预后意义。 目前的研究旨在根据 ALL 患者的预后对其进行分层,并通过药物遗传学方法预测其结果。 将从 1994 年至 2008 年间在韩国首尔成均馆大学医学院三星医疗中心 (SMC) 诊断出的 130 种成年 ALL 患者的 130 种基因型生成预测模型。 预测模型的验证将使用 ALL 患者的独立外部队列进行。
- 队列定义:来自 SMC 的 200 名 ALL 患者作为测试集,另外 100 名来自 SMC 的患者作为第一验证集,另外 150 名独立的外部患者作为第二外部验证集。 将从诊断时收集的患者样本中提取并储存 DNA。
- 在测试集中,将使用基于 MALDI-TOF 的平台(Sequenom,圣地亚哥,加利福尼亚州,美国)确定涉及 DNA 修复途径、药物代谢/转运途径和叶酸代谢途径的候选基因的 130 个 SNP 的基因型。
- 将进行生物信息学分析,以从这 130 个单核苷酸多态性中识别出大约 13 种基因型 (10%) 在测试集中的治疗结果、药物毒性和预后方面具有最强的预测意义。
- 这 13 种基因型将在第一批 100 名 ALL 患者中使用多变量 Cox 比例风险模型进行验证。
- 预测模型将基于 Cox 比例风险模型建立,该模型源自 13 种候选基因型和临床风险因素。
- 基于药物遗传学信息的预测模型将在 150 名 ALL 患者的第二个独立外部队列中再次验证。
除 BCR/ABL 融合基因外,急性淋巴细胞白血病 (ALL) 的遗传或分子标记物的明确预后价值尚未确定。 目前的研究试图建立一个基于单核苷酸多态性(SNPs)的预测模型,利用药物遗传学方法,使用 DNA 修复途径、药物代谢/转运途径和叶酸代谢途径等多个候选途径中的 130 种基因型。 将针对成年 ALL 患者的治疗结果、药物毒性和预后生成并验证基于 SNP 的预测模型。
本研究将证明: 1) 从参与 DNA 修复途径、药物代谢/转运途径和叶酸代谢途径的 SNP 中获得的药物遗传学信息有助于预测 ALL 患者的治疗结果、药物毒性和预后; 2) 基于药物遗传学信息的预测模型将是根据临床结果对所有患者进行分层的有效且合理的方法; 3)基于SNP的预测模型可以合理应用于ALL患者的治疗,成为进一步改善治疗结果的依据; 4) 最后,该项目将加强和促进血液学领域的药物遗传学研究,从而使该团队引领世界药物遗传学研究。
研究概览
地位
条件
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
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Seoul、大韩民国、135-710
- 招聘中
- Samsung Medical Center
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接触:
- Dong Hwan Kim, M.D., Ph. D.
- 电话号码:+82-2-3410-1768
- 邮箱:dr.dennis.kim@samsung.com
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首席研究员:
- Dong Hwan Kim, M.D.,Ph.D.
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 核心结合因子阳性急性髓性白血病患者
- 18岁或以上
- 患者接受标准化疗
- 患者在诊断时有可用的医疗记录和存储的骨髓标本
排除标准:
- 没有明确的标准
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
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成人急性淋巴细胞白血病
患者被诊断为成人急性淋巴细胞白血病。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
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反应速度
大体时间:入学后1个月内
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入学后1个月内
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次要结果测量
结果测量 |
大体时间 |
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总生存期和无进展生存期
大体时间:入学后1个月内
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入学后1个月内
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (估计)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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