使用存档的石蜡包埋肿瘤标本分析乳腺癌的预后和预测基因组特征

将从 NUH 乳腺癌登记处选出 800 名符合资格标准的乳腺癌患者（400 名用于培训，400 名用于验证）。 符合条件的患者应在 NUH 进行至少 5 年的随访，并在 NUH 病理学系存储可用的石蜡包埋肿瘤块档案。 来自每个肿瘤块的 8-10 个 10 微米切片将被切割并从切片中提取 RNA。 然后使用高通量基因表达平台（Illumina Veracode 分析、Affymetrix Quantigene 分析）对 RNA 进行分析。 原始基因表达数据将应用于新加坡基因组研究所先前生成的以下签名：

1. 32 基因 p53 通路特征
2. 5基因遗传等级特征
3. 33 基因 TuM1 签名
4. 10 基因 ER 特征 (Miller & Tan, et. 等人，未发表）
5. 6 基因 3 比例预测因子（Miller & Karuturi 等人） 等人，未发表）
6. 5 基因 HER2 扩增子预测因子 (Miller & Karuturi, et. 等人，未发表）
7. 7 基因 Basal-Luminal 鉴别器（Miller，未发表）

这些特征的预后和/或预测能力将与传统的临床预后因子和预测因子进行比较，目的是在未来开发用于乳腺癌管理的存档肿瘤衍生基因组测试。

存档的石蜡包埋肿瘤块是临床使用后的剩余样本。 它们不是已同意用于研究目的的样本。 我们请求放弃同意，因为这是一项风险最小的研究。 我们将确保留下足够的组织用于未来的常规诊断目的。 从每个肿瘤中取出的切片将被编码，没有患者标识符，以保护参与者的隐私和机密。

本研究中肿瘤样本产生的结果不会影响患者的临床管理。