Analyse des signatures génomiques pronostiques et prédictives à l'aide d'échantillons de tumeurs d'archives inclus dans la paraffine dans le cancer du sein

Principaux objectifs d'étude:

1. Créer un dispositif pronostique basé sur l'expression génique qui complète ou dépasse l'utilité pronostique des biomarqueurs conventionnels des résultats du cancer du sein.
2. Pour identifier un ou plusieurs sous-groupes cliniques de patients pour lesquels le dispositif pronostique surpasse, ou augmente substantiellement, la performance pronostique des marqueurs conventionnels qui déterminent actuellement les stratégies thérapeutiques.

Sous-objectifs d'étude:

1. Évaluer la valeur pronostique des multiples signatures d'expression génique, seules et en combinaison, en utilisant une large cohorte de patientes atteintes d'un cancer du sein pour lesquelles la pathologie, le traitement et les résultats sont disponibles. Une conception "formation" et "test" est proposée.
2. Évaluer l'utilité d'un dispositif pronostique qui mesure les niveaux d'expression génique à partir d'échantillons inclus dans la paraffine fixés au formol (FFPE) de tumeurs primaires réséquées. Les enquêteurs utiliseront le test Affymetrix Quantigene 2.0 et/ou le test d'expression génique Illumina BeadXpress VeraCode DASL (IVDMIA approuvé par la FDA).
3. Pour des sous-groupes cliniques spécifiques de patients/tumeurs, les chercheurs identifieront mathématiquement les relations pronostiques additives ou synergiques entre les gènes et les signatures génétiques qui, en combinaison, donneront une prédiction du risque maximal (survie sans métastases à distance) pour les patients.
4. Comparez l'utilité pronostique du dispositif des chercheurs à celle des variables pronostiques conventionnelles qui sont actuellement utilisées pour déterminer la stratégie thérapeutique.
5. Incorporer les signatures pronostiques dans un algorithme de pronostic pratique qui cherche à inclure des mesures conventionnelles de résultats telles que la taille de la tumeur, le grade histologique, l'état nodal, l'âge du patient ou l'indice de Nottingham, etc.

Les chercheurs émettent l'hypothèse qu'une qualité et une quantité adéquates d'ARN tumoral peuvent être extraites d'échantillons de tumeurs d'archives inclus dans la paraffine pour le profilage de l'expression génique, et que les signatures génomiques dérivées de tumeurs d'archives peuvent être utilisées comme pronostiqueurs ou prédicteurs du cancer du sein.