台湾线粒体nt3243 A>G突变
台湾地区线粒体nt3243 A>G突变的临床特征及预后因素
研究概览
地位
详细说明
患者和临床特征。 该研究将在台北的三级医疗中心国立台湾大学医院进行。 台大医院医学遗传科接受转诊,并为全台医院进行基因检测。 我们将审查所有记录有线粒体 DNA nt3243 点突变的患者的病历。 人口统计学数据、症状发作时的年龄、临床特征(包括中风、癫痫样发作、乳酸水平、糖尿病、听力障碍、肌病、心电图异常、慢性进行性外眼肌麻痹)、相关家族史、治疗和结果将是记录。 完整的 MELAS 表型被定义为存在局灶性中枢神经系统事件,癫痫发作、中风或两者兼而有之。
遗传分析。 使用 Puregene DNA 纯化试剂盒(Gentra Systems,Minneapolis,Minnesota,USA)从外周血白细胞中提取基因组 DNA。 线粒体 DNA nt3243 点突变的聚合酶链反应 (PCR) 由左侧引物 5'-cggagtaatccaggtcggtt-3' 和右侧引物 5'-ggaattgaacctctgactgt-3' 进行。 在 Hae III 限制酶消化后检测到线粒体 DNA nt3243 A>G 突变的存在。
如先前报道的那样,通过实时扩增难治性突变系统定量 PCR (ARMS-qPCR) 测定法检测线粒体 nt3243A>G 突变的异质性 [19]。 简而言之,将野生型和突变靶标引物各 500 nM 添加到 10 ml PCR 反应中,该反应含有 1X KAPA SYBR® FAST ABI Prism® qPCR Master Mix(KAPABIOSYSTEMS,货号 KK4603)和 4 ng 基因组脱氧核糖核酸。 实时 PCR 条件为 50°C 2 分钟,95°C 20 秒,然后是 40 个循环,95°C 变性 15 秒,62°C 退火/延伸 30 秒。 通过ABI StepOnePlusTM Real-Time PCR System (Applied Biosystems)和StepOne软件v2.1 (Applied Biosystems)记录和分析PCR产物的交叉点和浓度荧光信号强度数据。 线性指数期内的阈值循环(CT值)用于构建标准曲线和测量DNA模板的原始拷贝数。 使用以下公式计算突变mtDNA的百分比:异质性%= 1 /(1 + 1/2△CT)。
统计分析。 SPSS 17.0 (SPSS, Chicago, IL, USA) 用于统计分析。 在适当的情况下,结果以中位数和范围或均值 ± 1 SD 的形式给出。 学生 t 检验用于比较未配对的组。 Fisher 精确检验用于确定两个分类变量之间的关联。 Cox回归模型用于分析可能的预后因素。 通过 Kaplan-Meier 估计和对数秩检验比较结果的组间差异。 Pearson 相关性用于将异质性与诊断年龄相关联。 p 值 < 0.05 被认为具有统计学意义。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习地点
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Taipei、台湾、100
- 招聘中
- National Taiwan University Hospital
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接触:
- Han-Chung Hsiue, MD
- 电话号码:66064 886-23123456
- 邮箱:hanchunghsiue@gmail.com
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首席研究员:
- Pei-Lin Lee, MD, PhD
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副研究员:
- Ni-Chung Lee, MD, PhD
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- OLDER_ADULT
- 孩子
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
-线粒体DNA nt3243 A>G突变患者
排除标准:
-未确认线粒体 DNA nt3243 A>G 突变的患者
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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预后不良的预后因素
大体时间:在随访期内,估计平均为 5 年。
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不良结果包括死亡和表现不佳的发展(改良 Rankin 量表 4 或更高)。
将使用单变量和多变量分析来研究特定的临床表现(例如,中风、癫痫发作、糖尿病等的存在)和异质性程度是否与不良结果相关。
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在随访期内,估计平均为 5 年。
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Pei-Lin Lee, MD, PhD、National Taiwan University Hospital
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (估计)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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