鉴定与 SMN1 基因顺式复制相关的生物标志物 (BADGES)

脊髓性肌萎缩症 (SMA) 是一种神经肌肉疾病，其特征是脊髓前角运动神经元丢失并导致肌肉萎缩。 SMA 具有常染色体隐性遗传，影响 6000 名婴儿中的 1 名，携带者频率为 40 分之一。 在大多数情况下，它是由5q11-q13上的SMN1基因（0+0基因型）的纯合基因缺失或基因转换引起的。 这个基因组区域在进化过程中被复制和反转。 因此 SMN1 基因有一个非常同源的拷贝，称为 SMN2。 遗传咨询旨在检测只有一个 SMN1 基因拷贝（0+1 基因型）的携带者。 SMA 载体测试依赖于通过定量 PCR 方法对 SMN1 拷贝进行的总拷贝数量化。 然而，SMN1 基因在一个等位基因上的顺式重复和第二个等位基因上的缺失（2+0 基因型）可能导致误解，因为分子方法显示 SMN1 基因有 2 个拷贝并且无法检测携带者状态。

该研究的目的是表征特定于 SMN1 基因顺式复制的生物标志物，以便检测构成遗传咨询陷阱的这种 2+0 基因型。 我们将使用分子梳理来识别基因组莫尔斯电码 (GMC)，该密码由顺式重复染色体上特定结构基序的探针组合组成。 该 GMC 的表征基于两个样本组的比较：

• 测试组，最多 137 人携带 3 个 SMN1 基因拷贝（表明一个等位基因顺式重复）
• control-1组，最多137人携带2个SMN1基因拷贝

需要对两组中的 24 个样本进行初步研究，以确定研究统计分析所需的确切样本数。 当对 GMC 进行表征时，将通过测试两个样本组来评估其特异性：

• 测试组，37人携带3个SMN1基因拷贝
• control-2 组，37 人携带 3 个 SMN2 基因拷贝 分子梳理需要长 DNA 纤维，通常的 DNA 提取方法不合适。 该项目需要新的血液样本来提取特定的 DNA。

如果这个项目成功，在第二个项目中，这个 GMC 将被转换成一种简单且廉价的基于 PCR 的方法。 然后，我们将评估这种方法对我们的样本集合的敏感性，特别是对具有由家族基因分型定义的 2+0 基因型的个体。