Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Identifikace biomarkeru spojeného s Cis-duplikací genu SMN1 (BADGES)

23. července 2019 aktualizováno: University Hospital, Rouen

Identifikace biomarkeru spojeného s cis-duplikací genu SMN1 s cílem zlepšit genetické poradenství v rodinách se spinální svalovou atrofií

Spinální svalová atrofie (SMA) je neuromuskulární porucha charakterizovaná ztrátou motorických neuronů v předním rohu míšním a vedoucí ke svalové atrofii. SMA má autozomálně recesivní dědičnost a postihuje 1 z 6 000 kojenců s frekvencí přenašečů 1 ze 40. Ve většině případů je způsobena homozygotní genovou delecí nebo genovou konverzí genu SMN1 (0+0 genotyp) na 5q11-q13. Tato genomická oblast byla během evoluce duplikována a invertována. Gen SMN1 má tedy velmi homologní kopii zvanou SMN2. Genetické poradenství se zaměřuje na detekci přenašečů pouze s jednou kopií genu SMN1 (0+1 genotyp). Testování nosičů SMA se opírá o kvantifikaci celkového počtu kopií kopií SMN1 pomocí kvantitativních metod PCR. Nicméně cis-duplikace genu SMN1 na jedné alele a delece na druhé alele (genotyp 2+0) může vést k nesprávné interpretaci, protože molekulární metody ukazují 2 kopie genu SMN1 a nemohou detekovat stav přenašeče.

Cílem studie je charakterizace biomarkeru specifického pro cis-duplikaci genu SMN1 s cílem umožnit detekci tohoto genotypu 2+0, který představuje past pro genetické poradenství. Pomocí molekulárního česání identifikujeme genomickou morseovu abecedu (GMC) složenou z kombinace sond specifických pro strukturní motiv na cis-duplikačním chromozomu. Charakterizace tohoto GMC je založena na srovnání dvou skupin vzorků:

  • Testovaná skupina s maximálně 137 jedinci nesoucími 3 kopie genu SMN1 (navrhující cis-duplikaci na jedné alele)
  • Kontrolní skupina 1 s maximálně 137 jedinci nesoucími 2 kopie genu SMN1

Pilotní studie provedená na 24 vzorcích ve dvou skupinách je potřebná k definování přesného počtu vzorků nezbytného pro statistickou analýzu studie. Když bude GMC charakterizována, bude její specifičnost vyhodnocena testováním dvou skupin vzorků:

  • Testovaná skupina s 37 jedinci nesoucími 3 kopie genu SMN1
  • Skupina kontrolních 2 s 37 jedinci nesoucími 3 kopie genu SMN2 Molekulární česání potřebuje dlouhá vlákna DNA a obvyklé metody extrakce DNA nejsou vhodné. Tento projekt vyžaduje nové vzorky krve pro specifickou extrakci DNA.

Pokud bude tento projekt úspěšný, během druhého projektu bude tento GMC převeden na jednoduchou a levnou metodu založenou na PCR. Poté vyhodnotíme citlivost této metody na našem souboru vzorků, zejména na jedincích s genotypem 2+0 definovaným familiární genotypizací.

Přehled studie

Postavení

Ukončeno

Podmínky

Intervence / Léčba

Typ studie

Intervenční

Zápis (Aktuální)

48

Fáze

  • Nelze použít

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

  • Francie
      • Nantes, Francie
        • Nantes University Hospital
      • Rouen, Francie, 76031
        • Rouen University Hospital

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Dospělý jedinec
  • Jedinec s buď 2 kopiemi genu SMN1 (kontrolní skupina-1), 3 kopiemi genu SMN1 (testovaná skupina) nebo 3 kopiemi genu SMN2 (kontrolní skupina-2).
  • Fyzická osoba se sociálním pojištěním
  • Podepsaný formulář souhlasu

Kritéria vyloučení:

  • Těhotné ženy, kojící ženy
  • Fyzická osoba bez svobody správním rozhodnutím nebo soudním rozhodnutím nebo fyzická osoba pod správním dohledem nebo právním opatrovníkem

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Primární účel: Diagnostický
  • Přidělení: Nerandomizované
  • Intervenční model: Paralelní přiřazení
  • Maskování: Žádné (otevřený štítek)

Zbraně a zásahy

Skupina účastníků / Arm
Intervence / Léčba
Experimentální: Subjekt nesoucí 3 kopie genu SMN1
Pomocí odběru krve, použití molekulárního česání k identifikaci genomové morseovy abecedy (GMC) složené z kombinace sond specifických pro strukturní motiv na cis-duplikačním chromozomu.
Postup: odběr krve
Vzorek krve bude odebrán subjektu nesoucímu specifický genotyp
Jiný: Subjekt nesoucí 2 kopie genu SMN1
Pomocí odběru krve, použití molekulárního česání k identifikaci genomové morseovy abecedy (GMC) složené z kombinace sond specifických pro strukturní motiv na cis-duplikačním chromozomu.
Postup: odběr krve
Vzorek krve bude odebrán subjektu nesoucímu specifický genotyp
Jiný: Subjekt nesoucí 3 kopie genu SMN2
Pomocí odběru krve, použití molekulárního česání k identifikaci genomové morseovy abecedy (GMC) složené z kombinace sond specifických pro strukturní motiv na cis-duplikačním chromozomu.
Postup: odběr krve
Vzorek krve bude odebrán subjektu nesoucímu specifický genotyp

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Časové okno
Identifikace genetické signatury indikující přítomnost jedné alely se 2 kopiemi v cis genu SMN1.
Časové okno: Den 1
Den 1

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Specifičnost genetického podpisu
Časové okno: Den 1
Specifičnost genetického podpisu bude provedena pomocí analýzy jedince nesoucího buď 3 kopie genu SMN1 nebo 3 kopie genu SMN2
Den 1

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

University Hospital, Rouen

Spolupracovníci

Society GENOMIC VISION

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Thierry FREBOURG, MD, Rouen University Hospital

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

15. prosince 2015

Primární dokončení (Aktuální)

4. července 2016

Dokončení studie (Aktuální)

4. července 2016

Termíny zápisu do studia

První předloženo

14. září 2015

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

14. září 2015

První zveřejněno (Odhad)

15. září 2015

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

24. července 2019

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

23. července 2019

Naposledy ověřeno

1. července 2019

Více informací

Termíny související s touto studií

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 2015/092/HP

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na odběr krve

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Germany

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit