亚胺培南耐药铜绿假单胞菌定植的慢性阻塞性肺病患者的肺部微生物群 (MiPAD)

患者：在兰斯教学医院肺科住院的严重 COPD 患者（FEV1/用力肺活量 (FVC)<70%，支气管扩张后 FEV1<50%）。 在纳入时，患者应该是稳定的。 纳入 20 名患者总共需要 100 名患者将需要 24 个月。与定植到 PA 和 PA 突变体 OprD 的相关因素的研究将仅对已知不是 PA 携带者的患者进行。 将对所有被 PA 定植的患者和随机选择的非 PA 定植患者进行微生物群表征。 PA 定植对 COPD 演变影响的分析将在对包括的所有患者取样后 12 个月进行。

评价标准：

• 存在铜绿假单胞菌对亚胺培南的耐药性（OprD 突变）
• 肺微生物群：确定细菌负荷（细菌总数）和细菌群落多样性。 然后，将在门、纲、目和科水平上分析操作分类单元 (OTU) 的相对丰度。
• 与 PA 和 PA 突变体 OprD 定植相关的因素：抗生素、皮质类固醇、纳入前一年的住院治疗、COPD 的严重程度、咳嗽和咳痰的呼吸道症状、通过改良呼吸医学委员会 (MMRC) 调查问卷评估的劳力性呼吸困难、co-病态。
• PA 移植影响和 PA 突变体 OprD 对 12 个月变化的影响：恶化次数、恶化严重程度、住院次数、通过圣乔治呼吸问卷评估的生活质量、死亡、阻塞性通气障碍的演变。

调查：

• 提议让所有符合条件的患者参与肺科咨询
• 如果参与验收（签署知情同意书）：3个细菌学样本：痰液（通常完成），清洗前用清水漱口（专为本研究制作）。 患者的医疗护理（治疗、监测等）没有变化。 临床数据收集：COPD 标准、肺功能、呼吸困难和痰症状，通过 MMRC 量表评估，通过 St George's 呼吸问卷评估的生活质量，过去 12 个月的抗生素治疗和住院情况。 作为患者定期监测的一部分，在取样后 12 个月重新评估（同上）。 所有样本都将像通常对样本所做的那样被送到细菌学临床实验室 (CHU Reims)：将样本分成两部分：一份储存在 -80°C 下，另一份通常进行分析。 然后，根据痰液分析将患者分类为 PA 或 PA 非定植。 oprD 中的突变将在第二步中进行表征，以将患者分类为 PA 或 PA OprD 突变携带者。 所有定植有 PA 的患者和随机选择的非 PA 定植患者的样本（已储存在 -80°C）将被发送到 Institut Pasteur de Lille 的“PEGASE”平台。 肺部微生物群的表征将通过 Illumina“MiSeq”上的高通量测序进行，允许在 2x300 bp 配对末端中达到 2400 万个读数。