Imipenemre rezisztens P. Aeruginosa által megtelepedett krónikus obstruktív tüdőbetegségben szenvedő betegek tüdőmikrobiótája (MiPAD)

Betegek: Súlyos COPD-s betegek (FEV/Forced vital kapacitás (FVC)<70% és FEV<50% hörgőtágítás után) a Reims Oktatókórház pulmonológiai osztályán kórházba kerültek. A befogadáskor a betegeknek stabilnak kell lenniük. 20 beteg bevonása, akiknek összesen 100 betegre van szükségük, 24 hónapot vesz igénybe. A PA és PA mutáns OprD kolonizációjával kapcsolatos tényezők vizsgálatát csak olyan betegeknél végezzük, akikről ismert, hogy nem PA-hordozók. A mikrobiota jellemzését minden PA-val kolonizált betegen és a PA-val nem kolonizált betegeken véletlenszerűen kiválasztották. A PA kolonizáció COPD evolúcióra gyakorolt ​​hatásának elemzését a mintavétel után 12 hónappal elvégzik az összes beteg esetében.

Értékelési szempontok:

• A P. aeruginosa imipenemmel szembeni rezisztencia jelenléte (OprD mutáció)
• Tüdőmikrobióta: A baktériumterhelés (összes baktériumszám) és a baktériumközösségek diverzitásának meghatározása. Ezután az operatív taxonómiai egység (OTU) relatív abundanciáját elemezzük törzs, osztály, rend és család szintjén.
• PA-val és PA-mutáns OprD-vel való kolonizációval kapcsolatos tényezők: antibiotikumok, kortikoszteroidok, kórházi kezelés a felvételt megelőző évben, a COPD súlyossága, légúti köhögési és köptetési tünetek, megerőltetési nehézlégzés kérdőíves értékelése a módosított Respiratory Medical Council (MMRC), társ- megbetegedések.
• PA porting Influence és PA mutáns OprD a 12 hónapos változásokra: az exacerbációk száma, az exacerbációk súlyossága, a kórházi kezelések száma, a Szent György légúti kérdőív alapján értékelt életminőség, halálozás, lélegeztetési zavarok kialakulása obstruktív.

Vizsgálat:

• Javaslat a pulmonológiai konzultáción való részvételre minden jogosult betegnek
• Ha részt vesz az elfogadásban (aláírt beleegyező nyilatkozat): 3 bakteriológiai minta: Köpet (általában történik), mosás előtt vízzel szájmosás (kifejezetten ehhez a vizsgálathoz készült). Nincs változás a beteg egészségügyi ellátásában (kezelés, monitorozás, stb...). Klinikai adatgyűjtés: a COPD kritériumai, a tüdőfunkció, a nehézlégzés és a köpet tünetei, az MMRC skálával értékelve, a St George's légúti kérdőívvel értékelt életminőség, az antibiotikum-terápia és a kórházi kezelés az elmúlt 12 hónapban. Átértékelés 12 hónappal a mintavétel után a betegek rendszeres monitorozása részeként (mint korábban). Az összes mintát a bakteriológiai klinikai laboratóriumba (CHU Reims) küldik, ahogyan a minták esetében szokás: a minta szétválasztása 2 részre: 1 rész -80 °C-on tárolva, 1 rész pedig általánosan elemzett. Ezután a köpetelemzés alapján a betegek PA-nak vagy nem kolonizált PA-nak minősülnek. Az oprD mutációját egy második lépésben jellemezzük, hogy a betegeket PA vagy PA OprD mutáns hordozókként osztályozzuk. A PA-val kolonizált és a PA-val nem kolonizált betegek véletlenszerűen kiválasztott, -80°C-on tárolt mintái elküldésre kerülnek az Institut Pasteur de Lille "PEGASE" lemezformájára. A tüdőmikrobióta jellemzését nagy áteresztőképességű szekvenálással végzik az Illumina "MiSeq"-en, amely lehetővé teszi 24 millió leolvasás elérését 2x300 bp-os páros végén.