快速全基因组测序研究 (rWGS)

快速全基因组测序 (rWGS) 是一项新技术，能够在短短 26 小时内对儿童期遗传病进行症状驱动的诊断。 RCIGM 的研究人员表明，rWGS 对疑似基因诊断的重症婴儿的诊断率高于传统分子检测，诊断率高达 57%。 同样，在婴儿人群中，RCIGM 研究人员表明，这些诊断可用于指导临床护理，接受诊断的婴儿中有多达 70% 随后会改变管理。 在某些情况下，及时诊断会导致挽救生命的治疗。 RCIGM 研究人员表明，接受诊断的婴儿中有多达 25% 的后续管理发生变化以防止发病。 需要更多数据来确定这些结果是否在其他机构、其他种族和种族群体以及更多患者中发现。 需要更多数据来检验这种检测在新生儿和大龄儿童中的急性和长期临床效用，以及确定这种检测对其他机构的成本效益。 因此，这项研究将是多个站点的合作，与科学界以及医院管理部门、保险公司和其他可能有兴趣将 rWGS 作为一线临床试验推广的主要利益相关者共享 rWGS 的数据和经验未来。

该研究将提供与受影响患者症状相关的临床实验室确认结果，包括可选的偶然发现，除非受试者选择退出这些额外结果，以便将这些研究结果用于临床护理。 此外，这项研究将汇总有关来自多个地点的标准临床基因检测以及成本措施的数据，不仅可以确定诊断率、诊断准确性和诊断时间的差异，还可以确定该检测和后续变化的成本效益在护理管理中。 临床效用将被定义为直接从基因检测（阳性和阴性）结果得出的护理变化，包括标准临床检测和 rWGS。 该数据将用于进一步检查该测试的分析、诊断和临床效用以及成本效益。

rWGS 方法不断改进，儿科基因组医学是一个非常新的医学实践领域。 这项研究还将为研究人员提供有关传统医学结果和以患者为中心的结果方面的最佳实践的信息。 因此，这项研究也将作为样本和数据的生物资源库，因为在研究人员之间共享基因组和表型数据的能力对于加深我们对儿科基因组医学这一新兴领域的理解至关重要。

具体目标：

1. 从可能患有遗传病的急性儿科患者及其家庭成员（现象组）中收集生物样本和相关临床数据。
2. 创建、分析和存储来自生物样本的基因组数据。 基因组数据将包括基因组 (gDNA) 序列、RNA 序列和/或其他相关的组学数据（包括但不限于药物基因组学、转录组学和表观基因组学）。 来自 rWGS 的基因组数据将包括单核苷酸调用 (SNV)、结构变异，例如拷贝数测试、基因组重排、基因表达、“全转录组”或特定基因或所有基因外显子的更有限的 DNA 测序组（“外显子组”）。
3. 通过与标准临床基因检测进行比较，评估 rWGS 在从多个地点招募的急性病人群中对遗传疾病的诊断率。
4. 评估快速基因诊断在患者护理和管理中的临床效用。
5. 在许多站点检查这种快速测试的健康经济学和成本效益。
6. 研究和改进基因组学技术和软件，以增强对与儿童疾病和潜在治疗反应相关的理解和测试能力。
7. 为合格的研究人员和合作者提供标本和数据，以进一步了解罕见的儿童疾病和治疗反应。
8. 收集和关联来自各种人群和临床表现的基因组数据。
9. 为基于基因组的研究提供统一同意的样本和数据收集、采集方法、存储以及随后的 IRB 批准。
10. 通过使用新的研究技术分析和报告临床确认的基因组诊断和治疗指导。
11. 识别和研究新基因和疾病过程。