Estudo rápido de sequenciamento completo do genoma (rWGS)

O Rapid Whole Genome Sequencing (rWGS) é uma nova tecnologia capaz de fornecer diagnósticos baseados em sintomas de doenças genéticas com início na infância em menos de 26 horas. Os investigadores do RCIGM mostraram que o rWGS tem taxas de diagnóstico mais altas do que os testes moleculares tradicionais em bebês com doenças agudas com suspeita de diagnóstico genético, com taxas de diagnóstico de até 57%. Da mesma forma, na população infantil, os pesquisadores do RCIGM mostraram que esses diagnósticos são úteis no direcionamento do cuidado clínico, com até 70% dos bebês que recebem um diagnóstico tendo uma mudança subsequente no manejo. Em alguns casos, um diagnóstico oportuno resulta em tratamentos que salvam vidas. Os investigadores do RCIGM mostraram que até 25% dos bebês que recebem um diagnóstico apresentam uma mudança subsequente no manejo que evita a morbidade. Mais dados são necessários para determinar se esses resultados são encontrados em outras instituições, entre outros grupos étnicos e raciais e em maior número de pacientes. Mais dados são necessários para examinar a utilidade clínica aguda e de longo prazo de tais testes, tanto em recém-nascidos quanto em crianças mais velhas, bem como para determinar o custo-efetividade desse teste para outras instituições. Como tal, este estudo será uma colaboração de vários sites para compartilhar dados e experiências de rWGS com a comunidade científica, bem como administrações hospitalares, seguradoras e outras partes interessadas importantes que possam estar interessadas em promover o rWGS como um teste clínico de primeira linha em o futuro.

O estudo fornecerá resultados clínicos confirmados por laboratório relacionados aos sintomas do paciente afetado, incluindo achados incidentais opcionais, a menos que os participantes optem por não receber esses resultados adicionais, para permitir que esses achados de pesquisa sejam usados ​​no atendimento clínico. Além disso, este estudo agregará dados sobre testes genéticos clínicos padrão de vários locais, bem como medidas de custo para não apenas identificar diferenças nas taxas de diagnóstico, precisão diagnóstica e tempos para diagnósticos, mas também para determinar a relação custo-benefício desse teste e alterações subsequentes na gestão do cuidado. A utilidade clínica será definida como mudanças nos cuidados que decorrem diretamente dos resultados dos testes genéticos (positivos e negativos), incluindo testes clínicos padrão e rWGS. Esses dados serão usados ​​para examinar ainda mais a utilidade analítica, diagnóstica e clínica e a relação custo-benefício desse teste.

Os métodos rWGS continuam a melhorar e a medicina genômica pediátrica é um campo muito novo da prática médica. Este estudo também informará os investigadores sobre as melhores práticas, tanto em termos de resultados médicos tradicionais quanto de resultados centrados no paciente. Consequentemente, este estudo também atuará como um biorrepositório para amostras e dados, pois a capacidade de compartilhar dados genômicos e fenotípicos entre os pesquisadores é fundamental para o progresso de nossa compreensão do campo nascente da medicina genômica pediátrica.

Objetivos Específicos:

1. Coletar amostras biológicas e dados clínicos associados de pacientes pediátricos com doenças agudas que possam ter uma doença genética e seus familiares (Fenôme).
2. Para criar, analisar e armazenar dados genômicos das amostras biológicas. Os dados genômicos incluirão sequências genômicas (gDNA), sequências de RNA e/ou outros dados 'ômicos relacionados (incluindo, mas não limitados a, farmacogenômica, transcriptômica e epigenômica). Os dados genômicos do rWGS incluirão chamadas de nucleotídeo único (SNVs), variantes estruturais, como teste de número de cópias, rearranjos genômicos, expressão gênica, o "transcriptoma completo" ou painéis de sequenciamento de DNA mais limitados de genes específicos ou de todos os éxons de genes (os " Exoma").
3. Avaliar a taxa de diagnóstico de doenças genéticas por rWGS em uma população com doença aguda inscrita em vários locais com comparações com testes genéticos clínicos padrão.
4. Avaliar a utilidade clínica de diagnósticos genéticos rápidos no cuidado e manejo de pacientes.
5. Examinar a economia da saúde e a relação custo-eficácia deste teste rápido em muitos locais.
6. Investigar e melhorar as tecnologias e software de genômica para melhorar a compreensão e testar habilidades relacionadas a doenças infantis e possíveis respostas ao tratamento.
7. Disponibilizar espécimes e dados para pesquisadores e colaboradores qualificados para aprofundar a compreensão das doenças raras da infância e as respostas ao tratamento.
8. Coletar e correlacionar dados genômicos de uma ampla variedade de populações e apresentações clínicas.
9. Fornecer amostras e coletas de dados com consentimento uniforme, métodos de aquisição, armazenamento para estudos de pesquisa baseados em genoma com aprovações subsequentes do IRB.
10. Analisar e relatar diagnósticos genômicos clinicamente confirmados e orientações de tratamento por meio do uso de novas tecnologias de pesquisa.
11. Identificar e estudar novos genes e processos de doenças.