乳腺癌患者对 Palbociclib 的耐药性和免疫反应

研究人员提议对接受 Palbociclib (Palbo) 联合内分泌治疗的激素受体阳性 (HR+) 转移性乳腺癌 (BC) 患者的纵向配对肿瘤活检和血清进行生物标志物和分子谱分析研究。

研究人员计划从 40 名对 Palbo + 内分泌联合治疗产生获得性耐药的患者中获取治疗前和进展后的肿瘤活检和血液样本。 将对治疗前和治疗后样本同时进行所有测定，以确定可能导致获得性耐药性的差异。 细胞周期蛋白 E1 和 E2 水平将通过 IHC 对肿瘤活检进行评估。 Neuregulin-1水平将通过对血清的ELISA测定来评估。 将使用全外显子组测序 (WES) 和全转录组测序 (RNA-Seq) 进一步分析肿瘤活检。 匹配的血液样本将进行 WES 以促进体细胞突变检测。 配对的肿瘤活检将进行 TIL 标记的免疫组织化学 (IHC) 分析，以评估 Palbo 诱导的变化。 最后，我们将应用内部循环肿瘤 DNA (ctDNA) 检测分析 40 对血浆样本，该检测采用定制设计的面板来研究 Palbo 获得性耐药性。 自定义 ctDNA panel 将扩展到包括从本研究中确定的赋予获得性耐药性的其他突变。

为了进一步评估 Palbo 治疗对肿瘤内 TIL 的影响，研究人员计划在基线和 Palbo 治疗过程中的两个时间点（6 周、12 周）从 20 名患者中获取成对的肿瘤活检和匹配的血液样本。 在了解进展后活检是否可用之前，他们将选择对 Palbo 有反应的表现出稳定疾病 (SD) 的转移性 BC 患者进行肿瘤活检。 肿瘤活检将进行 WES、RNA-Seq 和 IHC 分析。 此外，研究人员计划使用流式细胞术 (FACS) 量化匹配血液样本中免疫细胞亚群的丰度，以评估 Palbo 治疗对系统免疫的影响。

虽然可以在开始 Palbo 治疗 6 周和 12 周后收集治疗样本，但初始治疗的 HR+ 晚期乳腺癌患者平均需要大约 18 个月才能产生获得性耐药性。 由于缺乏同意或难以操作的活检（例如仅骨转移），估计只有 40% 的复发病例会成功进行活检。 因此，研究人员计划在 2018 年第二季度之前将大约 100 名患者的治疗前活检和血液样本储存起来，以便在 2 年的时间范围内收集 40 名进展后活检作为匹配对。 FFPE 载玻片将由所有肿瘤活检组织制成，包括基线时的 100 个病例，并进行 H&E 染色。 研究人员将通过 H&E 数据的机器学习和数字成像分析来检测和量化 TIL。