De resistentie en immuunrespons op Palbociclib bij borstkanker

De onderzoekers stellen voor om een ​​biomarker- en moleculaire profileringsstudie uit te voeren in longitudinaal gepaarde tumorbiopten en serum van patiënten met hormoonreceptorpositieve (HR+) gemetastaseerde borstkanker (BC) behandeld met Palbociclib (Palbo) in combinatie met endocriene therapieën.

De onderzoekers zijn van plan om tumorbiopsie en bloedmonsters te verkrijgen, zowel voor de behandeling als na de progressie, van 40 patiënten die verworven resistentie ontwikkelen tegen Palbo + endocriene combinatiebehandeling. Alle assays zullen parallel worden uitgevoerd op zowel pre- als post-behandelingsmonsters om verschillen te identificeren die verantwoordelijk kunnen zijn voor verworven resistentie. Cycline E1- en E2-niveaus zullen worden beoordeeld door IHC op tumorbiopten. Neureguline-1-niveaus zullen worden beoordeeld door middel van een ELISA-assay op serum. Tumorbiopten zullen verder worden geprofileerd met behulp van whole-exome sequencing (WES) en whole-transcriptome sequencing (RNA-Seq). Gematchte bloedmonsters zullen worden onderworpen aan WES om detectie van somatische mutaties te vergemakkelijken. Gepaarde tumorbiopten zullen immunohistochemie (IHC)-analyse van TIL-markers ondergaan om door Palbo geïnduceerde veranderingen te beoordelen. Ten slotte zullen we de interne circulerend tumor-DNA-test (ctDNA), die gebruikmaakt van een op maat ontworpen panel voor het bestuderen van door Palbo verworven resistentie, toepassen op de analyse van 40 paren plasmamonsters. Het aangepaste ctDNA-panel zal worden uitgebreid met aanvullende mutaties die uit deze studie zijn geïdentificeerd en die verworven resistentie verlenen.

Om de effecten van Palbo-behandeling op intratumorale TIL's verder te evalueren, zijn de onderzoekers van plan om gepaarde tumorbiopsie en gematchte bloedmonsters te verkrijgen, bij aanvang en op twee tijdstippen (6 weken, 12 weken) tijdens de behandeling met Palbo, van 20 patiënten. En ze zullen gemetastaseerde BC-patiënten selecteren die stabiele ziekten (SD) vertonen als reactie op Palbo voor tumorbiopten, voordat bekend is of biopsie na progressie beschikbaar zou zijn. Tumorbiopten zullen worden onderworpen aan WES-, RNA-Seq- en IHC-analyses. Verder zijn de onderzoekers van plan om de overvloed aan subpopulaties van immuuncellen in de gematchte bloedmonsters te kwantificeren met behulp van flowcytometrie (FACS) om de effecten van de Palbo-behandeling op de systematische immuniteit te beoordelen.

Hoewel monsters tijdens de behandeling kunnen worden verzameld na 6 weken en 12 weken na het starten van de Palbo-behandeling, duurt het gemiddeld ongeveer 18 maanden voordat aanvankelijk behandelde patiënten met HR+-borstkanker in een laat stadium de verworven resistentie ontwikkelen. Slechts naar schatting 40% van de recidiverende gevallen zal succesvolle biopsieën hebben vanwege een gebrek aan toestemming of moeilijk te opereren biopsieën, zoals metastasen met alleen bot. Daarom zijn de onderzoekers van plan om vóór het tweede kwartaal van 2018 biopsieën en bloedmonsters van ongeveer 100 patiënten op te slaan om 40 biopsieën na progressie te verzamelen als gematchte paren binnen het tijdsbestek van 2 jaar. Er zullen FFPE-objectglaasjes worden gemaakt van alle tumorbiopten, inclusief de 100 gevallen bij aanvang, en onderworpen aan H&E-kleuring. De onderzoekers zullen TIL's detecteren en kwantificeren door middel van machine learning en digitale beeldanalyse van de H&E-gegevens.