Motstanden og immunresponsen mot Palbociclib i brystkreft

Etterforskerne foreslår å gjennomføre en biomarkør- og molekylær profileringsstudie i longitudinelt sammenkoblede tumorbiopsier og serum fra pasienter med hormonreseptorpositiv (HR+) metastatisk brystkreft (BC) behandlet med Palbociclib(Palbo) i kombinasjon med endokrine terapier.

Etterforskerne planlegger å innhente tumorbiopsi og blodprøver, tatt både før og etter progresjon, fra 40 pasienter som utvikler ervervet resistens mot Palbo + endokrin kombinasjonsbehandling. Alle analyser vil bli utført parallelt på prøver både før og etter behandling for å identifisere forskjeller som kan forklare ervervet resistens. Cyclin E1 og E2 nivåer vil bli vurdert av IHC på tumorbiopsier. Neuregulin-1-nivåer vil bli vurdert ved ELISA-analyse på serum. Tumorbiopsier vil bli ytterligere profilert ved bruk av hel-eksom-sekvensering (WES) og hel-transkriptom-sekvensering (RNA-Seq). Matchende blodprøver vil bli underlagt WES for å lette deteksjon av somatisk mutasjon. Parede tumorbiopsier vil gjennomgå immunhistokjemi (IHC) analyse av TIL-markører for å vurdere Palbo-induserte endringer. Til slutt vil vi bruke den interne sirkulerende tumor-DNA-analysen (ctDNA), som bruker et spesialdesignet panel for å studere Palbo-ervervet resistens, mot analyse av 40 par plasmaprøver. Det tilpassede ctDNA-panelet vil bli utvidet til å inkludere ytterligere mutasjoner identifisert fra denne studien som gir ervervet resistens.

For ytterligere å evaluere effekten av Palbo-behandling på intratumorale TIL-er, planlegger etterforskerne å innhente paret tumorbiopsi og matchede blodprøver, ved baseline og to tidspunkter (6 uker, 12 uker) i løpet av Palbo-behandlingen, fra 20 pasienter. Og de vil velge metastaserende BC-pasienter som viser stabile sykdommer (SD) som svar på Palbo for tumorbiopsier, før kunnskap om hvorvidt postprogresjonsbiopsi vil være tilgjengelig. Tumorbiopsier vil bli gjenstand for WES, RNA-Seq og IHC analyser. Videre planlegger etterforskerne å kvantifisere overfloden av immuncellesubpopulasjoner i de matchede blodprøvene ved å bruke flowcytometri (FACS) for å vurdere Palbo-behandlingseffekter på systematisk immunitet.

Mens prøver under behandling kan samles inn etter 6 uker og 12 uker etter oppstart av Palbo-behandling, tar det i gjennomsnitt ca. 18 måneder for initialbehandlede pasienter med sent stadium HR+ brystkreft å utvikle ervervet resistens. Bare anslagsvis 40 % av tilbakefallstilfellene vil ha vellykkede biopsier på grunn av manglende samtykke eller vanskelige å operere biopsier som for eksempel benmetastaser. Derfor planlegger etterforskerne å samle biopsier og blodprøver før behandling fra rundt 100 pasienter innen 2. kvartal 2018 for å samle inn 40 post-progresjonsbiopsier som matchede par innen en 2-års tidsramme. FFPE-objektglass vil bli laget fra alle tumorbiopsier, inkludert de 100 tilfellene ved baseline, og underlagt H&E-farging. Etterforskerne vil oppdage og kvantifisere TIL-er gjennom maskinlæring og digital bildeanalyse av H&E-data.