La résistance et la réponse immunitaire au palbociclib dans le cancer du sein

Les chercheurs proposent de mener une étude de biomarqueurs et de profilage moléculaire dans des biopsies tumorales appariées longitudinalement et du sérum de patients atteints d'un cancer du sein métastatique à récepteurs hormonaux positifs (HR+) traités avec du palbociclib (Palbo) en association avec des thérapies endocriniennes.

Les chercheurs prévoient d'obtenir une biopsie tumorale et des échantillons de sang, prélevés à la fois avant le traitement et après la progression, chez 40 patients qui développent une résistance acquise au traitement combiné Palbo + endocrinien. Tous les tests seront effectués en parallèle sur les échantillons avant et après le traitement afin d'identifier les différences pouvant expliquer la résistance acquise. Les niveaux de cycline E1 et E2 seront évalués par IHC sur des biopsies tumorales. Les niveaux de neuréguline-1 seront évalués par dosage ELISA sur sérum. Les biopsies tumorales seront profilées plus en détail à l'aide du séquençage de l'exome entier (WES) et du séquençage du transcriptome entier (RNA-Seq). Les échantillons de sang appariés seront soumis à WES pour faciliter la détection des mutations somatiques. Des biopsies tumorales appariées subiront une analyse immunohistochimique (IHC) des marqueurs TIL pour évaluer les changements induits par Palbo. Enfin, nous appliquerons le test interne d'ADN tumoral circulant (ctDNA), qui utilise un panel conçu sur mesure pour étudier la résistance acquise par Palbo, à l'analyse de 40 paires d'échantillons de plasma. Le panel d'ADNct personnalisé sera étendu pour inclure des mutations supplémentaires identifiées à partir de cette étude qui confèrent une résistance acquise.

Pour évaluer plus avant les effets du traitement Palbo sur les TIL intratumoraux, les chercheurs prévoient d'acquérir une biopsie tumorale appariée et des échantillons de sang appariés, au départ et à deux moments (6 semaines, 12 semaines) au cours du traitement Palbo, auprès de 20 patients. Et ils sélectionneront des patients BC métastatiques qui présentent des maladies stables (SD) en réponse à Palbo pour les biopsies tumorales, avant de savoir si une biopsie post-progression serait disponible. Les biopsies tumorales feront l'objet d'analyses WES, RNA-Seq et IHC. En outre, les chercheurs prévoient de quantifier l'abondance des sous-populations de cellules immunitaires dans les échantillons de sang appariés à l'aide de la cytométrie en flux (FACS) pour évaluer les effets du traitement Palbo sur l'immunité systématique.

Bien que des échantillons en cours de traitement puissent être prélevés après 6 semaines et 12 semaines après le début du traitement Palbo, il faut environ 18 mois en moyenne pour que les patientes initialement traitées atteintes d'un cancer du sein HR+ au stade avancé développent une résistance acquise. On estime que seulement 40 % des cas de rechute auront des biopsies réussies en raison d'un manque de consentement ou de biopsies difficiles à opérer telles que les métastases osseuses uniquement. Par conséquent, les enquêteurs prévoient de mettre en banque des biopsies de prétraitement et des échantillons de sang d'environ 100 patients d'ici le deuxième trimestre 2018 afin de collecter 40 biopsies post-progression sous forme de paires appariées dans un délai de 2 ans. Des lames FFPE seront fabriquées à partir de toutes les biopsies tumorales, y compris les 100 cas au départ, et soumises à la coloration H&E. Les chercheurs détecteront et quantifieront les TIL grâce à l'apprentissage automatique et à l'analyse par imagerie numérique des données H&E.