炎症性肠病淋巴细胞酪氨酸磷酸酶基因多态性

炎症性肠病 (IBD) 是胃肠道的慢性炎症性疾病，表现为克罗恩病 (CD) 和溃疡性结肠炎 (UC)，临床特征是缓解期被临床疾病活动的发作打断（Zallot 等人，2013 年） ). IBD 患者表现出一些常见症状，如严重腹泻、疼痛、疲劳和体重减轻，但定位略有不同：CD 影响整个胃肠道，而 UC 主要影响远端肠和回肠（De Lange 等人，2015 年） ).

伦纳德-琼斯等人。已经定义了宏观和微观标准来建立克罗恩病的诊断。 宏观诊断工具包括体格检查、内窥镜检查和放射学。 可以在粘膜活检和/或手术标本上评估微观特征。 诊断取决于不连续且通常为肉芽肿性肠道炎症的发现（Lennard-Jones 等，1997）。 溃疡性结肠炎的诊断基于病史、内镜表现、多次粘膜活检的组织病理学和适当的放射学（Silverberg 等人，2005 年；Satsangi 等人，2006 年）。

UC 的发病模式在过去二十年发生了变化，西方的发病率持续上升，亚洲和中东等以前发病率较低的地区的发病率也在上升（每 100,000 人 0.15-6.5 人）（Ng 等人，2017 年） ). 在 15 年期间（1995-2009），UC 诊断显着增加。 在开罗大学，1995-1999 年记录了 17 例，2005-2009 年记录了 76 例（Esmat 等，2014）。

CD 和 UC 都是复杂的遗传疾病，其中数百个独立的基因位点导致疾病易感性（Norouzinia 等，2015）。 然而，许多 IBD 相关基因的分子机制和功能仍然未知。 除了遗传学，IBD 还受到微生物和环境方面的强烈影响（Norouzinia 等人，2017 年）。

全基因组关联研究 (GWAS) 使人们能够更好地了解 IBD，因此，已经确定了 UC 和 CD 的几个遗传易感位点（Yamamoto-Furusho 等人，2015 年）。 在所涉及的遗传因素中，免疫系统分子中有几种多态性与 IBD 进展的易感性或保护作用相关，但即使是相互矛盾的关联，主要取决于发病（成人或儿童）、样本量差异和种族依赖性遗传背景（Neuman 等人，2012 年；Ng 等人，2012 年；Peng 等人，2017 年；Girardelli 等人，2018 年）。

PTPN22 蛋白包含三个结构域，包括：N 端 PTP 催化结构域；域间区域；和一个具有四个富含脯氨酸区域的 C 末端结构域，作为与其他蛋白质相互作用的基序（Stanford 等人，2014）。酪氨酸磷酸酶参与维持肠上皮屏障功能，调节自噬体功能和对入侵细菌的免疫反应在肠道细胞中，限制肠道中促炎细胞因子的分泌以及控制体内 CD4+ T 细胞的分化和功能（Spalinger 等人，2015 年）。 由 PTPN22 编码的淋巴样酪氨酸磷酸酶 (Lyp) 通过使 T 细胞受体激活依赖性激酶（Csk 激酶）去磷酸化，作为 T 细胞激活的负调节剂发挥关键作用（Cloutier 等人，1999）。 PTPN22 通过控制 NLRP3 酪氨酸磷酸化，是 NLRP3 炎性体（Nod 样受体家族含 3 个吡啶结构域）的关键调节剂。 此外，PTPN22 以自噬依赖性方式控制 NLRP3 介导的 IL-1beta 分泌（Yilmaz 等人，2018 年）。

PTPN22 基因位于 1 号染色体 (1p13.2) 的短臂上。 该基因有24个外显子（NCBI网站）。在PTPN22基因中发现了约21个SNP（rs1310182、rs3789604、rs33996649、rs1217414、rs2476601、rs12760457、rs2488457、、、、等）。SNP rs2476601（TC）外显子8 14 导致蛋白质产品中的精氨酸 620 被色氨酸残基取代（称为 620W 变体）（Spalinger 等人，2016）。 外显子 10 中的 SNP rs33996649 (G788>A) 介导精氨酸 263 被谷氨酰胺残基取代（称为 263Q 变体）并影响 Lyp 与 Csk 激酶相互作用的能力，从而避免复合物的形成和由此产生的抑制T 细胞激活（Hedjoudje 等人，2017 年）。 SNP rs2488457 (G -1123>C) 位于启动子区域 (Chen et al., 2013)。在 G 存在的情况下，预测激活蛋白 4 (AP-4) 的转录因子结合位点位于 -1123等位基因而不是 C 等位基因 (Jüliger et al., 2003)。

关于 PTPN22 基因 SNP 与 IBD 关联的矛盾结果已发表（Bank 等人，2014 年；Sfar 等人，2010 年；Chen 等人，2013 年；Latiano 等人，2007 年；Diaz-Gallo 等人， 2011 年，Wagenleiter 等人，2005 年，Zaid 等人，2018 年，Sadr 等人，2019 年）。

在埃及，有关 PTPN22 基因 SNP 与 1 型糖尿病（El-Kafoury 等人，2014 年）、ITP（Anis 等人，2011 年）、SLE（Elghzaly 等人，2015 年）、斑秃（ El-Zawahry 等人，2013 年）和 RA（Salama 等人，2014 年）}。

最新，没有发表关于 PTPN22 基因 SNP 与埃及人 IBD 关联的研究。