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Polimorfismos do gene da tirosina fosfatase linfóide na doença inflamatória intestinal

25 de fevereiro de 2020 atualizado por: Mennat-Allah Refaat Ali, Assiut University

Este estudo tem como objetivos:

  1. Investigar a associação entre polimorfismos de nucleotídeo único do gene PTPN22 (rs2476601, rs33996649 e rs2488457) e doença inflamatória intestinal.
  2. Correlacionar a relação entre os SNPs estudados e a atividade da doença/resposta à terapia.

Visão geral do estudo

Status

Desconhecido

Intervenção / Tratamento

Descrição detalhada

As doenças inflamatórias intestinais (DII) são distúrbios inflamatórios crônicos do trato gastrointestinal que se manifestam como doença de Crohn (DC) e colite ulcerosa (UC), caracterizadas clinicamente por períodos de remissão interrompidos por episódios de atividade clínica da doença (Zallot et al., 2013 ). Os pacientes com DII apresentam alguns sintomas comuns, como diarreia intensa, dor, fadiga e perda de peso, mas a localização é ligeiramente diferente: enquanto a DC afeta todo o trato gastrointestinal, a CU afeta principalmente o intestino distal e o íleo (De Lange et al., 2015 ).

Lennard-Jones et al. definiram critérios macroscópicos e microscópicos para estabelecer o diagnóstico da doença de Crohn. As ferramentas de diagnóstico macroscópico incluem exame físico, endoscopia e radiologia. As características microscópicas podem ser avaliadas na biópsia da mucosa e/ou espécime cirúrgico. O diagnóstico depende do achado de inflamação intestinal descontínua e muitas vezes granulomatosa (Lennard-Jones et al., 1997). O diagnóstico de colite ulcerativa é baseado na história, aspectos endoscópicos, histopatologia de múltiplas biópsias da mucosa e radiologia apropriada (Silverberg et al., 2005, Satsangi et al., 2006).

O padrão de incidência da UC mudou nas últimas duas décadas, com a incidência continuando a aumentar no Ocidente e aumentando a incidência em áreas anteriormente de baixa incidência, como a Ásia e o Oriente Médio (0,15-6,5 por 100.000) (Ng et al., 2017 ). Aumento acentuado nos diagnósticos de UC foi observado ao longo de um período de 15 anos (1995-2009). Na Universidade do Cairo, 17 casos foram registrados em 1995-1999 e 76 casos foram registrados em 2005-2009 (Esmat et al., 2014).

Tanto a DC quanto a UC são doenças geneticamente complexas, nas quais centenas de loci genéticos independentes contribuem para a suscetibilidade à doença (Norouzinia et al., 2015). No entanto, os mecanismos moleculares e as funções de muitos genes associados à DII permanecem desconhecidos. Além da genética, as DIIs são fortemente influenciadas por aspectos microbiológicos e ambientais (Norouzinia et al., 2017).

Os estudos de associação genômica ampla (GWAS) permitiram uma melhor compreensão da DII, assim, vários loci de suscetibilidade genética foram identificados para UC e CD (Yamamoto-Furusho et al., 2015). Entre os fatores genéticos envolvidos, existem vários polimorfismos em moléculas do sistema imunológico associados à suscetibilidade ou efeitos protetores à progressão da DII, mas mesmo com associações contraditórias, dependendo principalmente do início (adulto ou pediátrico), diferenças no tamanho da amostra e na fundo genético dependente de etnia (Neuman et al., 2012, Ng et al., 2012, Peng et al., 2017, Girardelli et al., 2018).

A proteína PTPN22 contém três domínios, incluindo: um domínio catalítico PTP N-terminal; uma região interdomínio; e um domínio C-terminal com quatro regiões ricas em prolina que funcionam como motivos para interação com outras proteínas (Stanford et al., 2014). A tirosina fosfatase está envolvida na manutenção da função da barreira epitelial intestinal, regulando a função do autofagossomo e as respostas imunes a bactérias invasoras nas células intestinais, limitando a secreção de citocinas pró-inflamatórias no intestino, bem como controlando a diferenciação e a função das células T CD4+ in vivo (Spalinger et al., 2015). A tirosina fosfatase linfóide (Lyp) codificada por PTPN22 desempenha um papel crítico como um regulador negativo da ativação de células T por desfosforilação de quinases dependentes de ativação de receptores de células T (Csk quinase) (Cloutier et al., 1999). O PTPN22 é um regulador crítico do inflamassoma NLRP3 (Nod Like Receptor Family Pyrine Domain Containing 3), controlando a fosforilação da tirosina NLRP3. Além disso, o PTPN22 controla a secreção de IL-1beta mediada por NLRP3 de maneira dependente da autofagia (Yilmaz et al., 2018).

O gene PTPN22 está localizado no braço curto do cromossomo 1 (1p13.2). Existem 24 exons no gene (site do NCBI). Cerca de 21 SNPs foram encontrados no gene PTPN22 (rs1310182, rs3789604,,,,etc).SNP rs2476601 (C1858>T 14 resulta na substituição da arginina 620 por um resíduo de triptofano no produto proteico (referido como variante 620W) (Spalinger et al., 2016). O SNP rs33996649 (G788>A) no exon 10 medeia a substituição da arginina 263 por um resíduo de glutamina (referido como variante 263Q) e afeta a capacidade de Lyp interagir com a Csk quinase, evitando assim a formação do complexo e a supressão resultante de ativação de células T (Hedjoudje et al., 2017). O SNP rs2488457 (G -1123>C) está localizado na região promotora (Chen et al., 2013). Um sítio de ligação do fator de transcrição para a proteína ativadora 4 (AP-4) na posição -1123 é previsto na presença do G alelo em vez do alelo C (Jüliger et al., 2003).

Resultados contraditórios foram publicados em relação à associação de SNPs do gene PTPN22 com IBD (Bank et al., 2014, Sfar et al., 2010, Chen et al., 2013, Latiano et al., 2007, Diaz-Gallo et al., 2011, Wagenleiter e outros, 2005, Zaid e outros, 2018, Sadr e outros, 2019).

No Egito, foram realizados estudos sobre a associação de SNPs do gene PTPN22 com DM tipo 1 (El-Kafoury et al., 2014), ITP (Anis et al., 2011), LES (Elghzaly et al., 2015), Alopecia Areata ( El-Zawahry et al., 2013) e RA (Salama et al., 2014) }.

Até o momento, nenhum estudo foi publicado sobre a associação de SNPs do gene PTPN22 com IBD em egípcios.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Antecipado)

200

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

18 anos a 60 anos (ADULTO)

Aceita Voluntários Saudáveis

N/D

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

Os pacientes com DII serão diagnosticados de acordo com as diretrizes estabelecidas para UC/CD. As características fenotípicas da UC e DC foram definidas de acordo com a classificação de Montreal. A atividade clínica da doença será avaliada usando a classificação de Montreal da atividade da doença UC e o Índice de Atividade da Doença de Crohn (CDAI) para DC

Descrição

Critério de inclusão:

  • pacientes com doença inflamatória intestinal

Critério de exclusão:

  • Pacientes com doenças autoimunes sistêmicas (AR,LES) serão excluídos do estudo.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
A
pacientes com doença inflamatória intestinal
Polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição de PCR
B
indivíduos saudáveis
Polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição de PCR

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Associação entre polimorfismos de nucleotídeo único do gene Lymphoid Tyrosine Phosphatase (rs2476601, rs33996649 e rs2488457) e doença inflamatória intestinal
Prazo: linha de base
Três polimorfismos de nucleotídeo único no gene da tirosina fosfatase linfoide (SNP (G788>A) no exon10, SNP (C1858>T) no exon 14 e SNP (G -1123>C) na região promotora) serão avaliados em 100 pacientes diagnosticados como doença inflamatória intestinal e 100 indivíduos saudáveis ​​por polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição de reação em cadeia da polimerase (PCR-RFLP) para detectar associação entre esses polimorfismos e doença inflamatória intestinal
linha de base

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Correlacionar a relação entre os SNPs estudados e a atividade da doença/resposta à terapia.
Prazo: linha de base
Taxa de hemossedimentação sérica, proteína C-reativa, anticorpo antinuclear, anticorpo anticitoplasma de neutrófilos (ANCA) e anti Saccharomyces cerevisiae (ASCA) e calprotectina fecal serão feitos em todos os pacientes. Os três polimorfismos investigados em LYP serão correlacionados com os marcadores de atividade da doença e resposta dos pacientes com DII à terapia.
linha de base

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

Publicações e links úteis

A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (ANTECIPADO)

1 de maio de 2020

Conclusão Primária (ANTECIPADO)

1 de maio de 2021

Conclusão do estudo (ANTECIPADO)

1 de setembro de 2021

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

23 de fevereiro de 2020

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

25 de fevereiro de 2020

Primeira postagem (REAL)

26 de fevereiro de 2020

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (REAL)

26 de fevereiro de 2020

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

25 de fevereiro de 2020

Última verificação

1 de fevereiro de 2020

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Outros números de identificação do estudo

  • LYP polymorphisms in IBD

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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