罕见肾脏病个性化诊断平台搭建（NIKE）
慢性肾病（CKD）是一个主要的健康问题，其发病率和患病率不断增加，并有真正“流行病”的威胁。 越来越多的证据表明，罕见肾脏疾病的遗传病因学患病率很高，并且新的致病基因列表不断更新。 新一代测序（NGS）技术的最新进展极大地改善了罕见肾脏疾病的诊断。 尽管如此，NGS 仍会产生大量信息，需要遗传学家、肾病学家和生物信息学家的共同努力进行适当分析，以便以个性化方式整合临床和遗传信息。 此外，在选定的病例中，研究人员的贡献对于开发该疾病的实验模型以研究和了解致病特征并提出个性化治疗方法至关重要。 这种创新的综合诊断模式目前在世界各地的少数中心可用，并且不能轻易地转化为日常临床实践。
该研究的目的是建立一个集成的诊断算法，将罕见肾脏疾病的最新个性化诊断和治疗策略推广到托斯卡纳地区所有 40 岁以下的肾脏疾病患者。 该算法将基于参与中心和专门的多学科团队之间的持续交流。 诊断和治疗性能将在欧洲水平得到验证。
研究概览
地位
条件
研究类型
注册 (估计的)
阶段
- 不适用
联系人和位置
学习地点
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Firenze、意大利
- Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi
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Firenze、意大利
- Meyer Children's Hospital IRCCS
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Firenze、意大利
- USL Toscana Centro
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Pisa、意大利
- Azienda Ospedaliero Universitaria Pisana
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
接受健康志愿者
描述
纳入标准：
- 肾脏疾病家族史和/或父母近亲结婚史；
- 肾外受累（例如感音神经性听力损失）；
- 对治疗有抵抗力（例如免疫抑制）；
- 无肾功能衰竭的代谢性酸中毒或代谢性碱中毒；
- 超声检测每个肾脏至少有 2 个囊性病变或肾钙质沉着症；
- 根据 KDIGO 定义，超声检测肾脏和泌尿道先天性异常 (CAKUT) 和 CKD 分期 ≥ 2
- 知情同意书。
排除标准：
- 年龄 > 40
- 拒绝参加研究
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：诊断
- 分配：非随机化
- 介入模型：并行分配
- 屏蔽：无（打开标签）
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
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实验性的：致病变异
根据 ACMG 指南和临床表型，符合致病性生物信息学优先标准的变异以及文献中已报道的变异将被定义为致病变异
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患者将被转介到研究协调中心接受遗传咨询。
这将导致结论性的基因诊断。
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实验性的：潜在致病变异
符合生物信息学优先标准但显然与临床表型不相关并且之前未在文献中报道过的变异将被定义为潜在致病变异
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患者及其家属将在研究协调中心接受彻底的临床重新评估，以根据基因检测结果（反向表型分析）确定疑似疾病的诊断方法。
临床重新评估可能包括进行额外的临床和仪器测试，以及其他专业咨询。
这将为相当大比例的病例提供结论性的基因诊断，然后为这些病例提供遗传咨询。
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实验性的：意义不明的变体 (VUS)
符合表型但不符合生物信息学优先标准的变异将被定义为临床意义不确定的变异（VUS）
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研究人员将通过尿液来源的肾祖细胞（u-RPC）进行功能评估，以确定变异在确定临床表型中的作用。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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基因诊断的验证
大体时间：从登记（基因检测）到基因检测结果返回之日（最长6个月）
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研究人员将通过患者重新评估（反向表型分析）或体外功能研究来评估潜在致病变异和临床意义不确定的变异（VUS）在确定结论性基因诊断中的作用。 具体来说，在获得 ES 结果后，多学科团队将评估测序结果，并最终要求患者和/或家属进行额外的调查（例如实验室或影像学检查、具体会诊等），以寻找ES（反向表型分析）所提示的先前未被发现/忽视的遗传疾病迹象。 将要求对一部分患者进行 u-RPC 体外功能研究。 通过这些策略获得结论性诊断的患者数量将有助于工作流程的总体诊断率（结论性基因诊断数量/参与研究的患者数量）。 |
从登记（基因检测）到基因检测结果返回之日（最长6个月）
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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分子途径的鉴定
大体时间：从登记（基因检测）到最后一位患者最后一次就诊，预计长达 12 个月
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研究人员的目的是确定一些分子途径，这些途径可以代表携带潜在致病变异的患者的潜在治疗靶点。 为了实现这一目标，研究人员将对接受诊断性肾活检的患者的肾活检片段进行单细胞 RNA 测序。 在获得携带潜在致病变异的单个细胞的细胞内转录组后，研究人员将其 RNA 表达谱与从非突变患者获得的同类型细胞进行比较。 |
从登记（基因检测）到最后一位患者最后一次就诊，预计长达 12 个月
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探索基因编辑在罕见肾脏疾病中的适用性
大体时间：从登记（基因检测）到最后一位患者最后一次就诊，预计长达 12 个月
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研究人员将通过从携带致病突变的患者身上获得的 u-RPC 来探索 CRISPR/Cas9 基因编辑在罕见肾脏疾病中的适用性。 为了实现对疾病致病变异的拯救，研究人员将在从携带致病变异的患者中分离出的u-RPC中，对通过CRISPR/Cas9基因编辑方法识别出的遗传变异进行稳定校正。 |
从登记（基因检测）到最后一位患者最后一次就诊，预计长达 12 个月
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (实际的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
与本研究相关的术语
其他相关的 MeSH 术语
其他研究编号
- NIKE
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)？
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
研究美国 FDA 监管的设备产品
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