Создание платформы персонализированной диагностики редких заболеваний почек (NIKE)
Хроническая болезнь почек (ХБП) является серьезной проблемой здравоохранения, заболеваемость и распространенность которой постоянно растет, а также существует угроза настоящей «эпидемии». Сходящиеся данные свидетельствуют о высокой распространенности генетической этиологии редких заболеваний почек, а список новых генов, вызывающих заболевания, постоянно обновляется. Последние достижения в области технологий секвенирования нового поколения (NGS) привели к значительному улучшению диагностики редких заболеваний почек. Несмотря на это, NGS генерирует большое количество информации, которую необходимо должным образом проанализировать совместными усилиями генетиков, нефрологов и биоинформатиков, чтобы персонализированно интегрировать клиническую и генетическую информацию. Кроме того, в отдельных случаях вклад исследователей оказывается важным для разработки экспериментальных моделей заболевания, позволяющих изучить и понять патогенетические особенности и предложить персонализированный терапевтический подход. Такая инновационная интегрированная диагностическая парадигма в настоящее время доступна в нескольких центрах по всему миру и ее нелегко применить в повседневной клинической практике.
Целью исследования является создание интегрированного диагностического алгоритма, позволяющего распространить новейшие персонализированные стратегии диагностики и лечения редких заболеваний почек на всех пациентов в регионе Тоскана в возрасте до 40 лет с заболеваниями почек. Этот алгоритм будет основан на постоянном взаимодействии между участвующими центрами и специальной многопрофильной командой. Диагностические и терапевтические характеристики будут проверены на европейском уровне.
Обзор исследования
Статус
Условия
Вмешательство/лечение
- Диагностический тест: Заключительное генетическое тестирование
- Диагностический тест: Генотип-фенотипическая корреляция для персонализированной диагностики
- Диагностический тест: Персонализированное изучение вариантов неопределенной клинической значимости (ВУЗ) посредством функциональных исследований на 3D-органе-на-чипе
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Firenze, Италия
- Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi
-
Firenze, Италия
- Meyer Children's Hospital IRCCS
-
Firenze, Италия
- USL Toscana Centro
-
Pisa, Италия
- Azienda Ospedaliero Universitaria Pisana
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Описание
Критерии включения:
- семейный анамнез заболеваний почек и/или кровное родство родителей;
- внепочечное поражение (например, нейросенсорная тугоухость);
- устойчивость к лечению (например, иммуносупрессивному);
- метаболический ацидоз или метаболический алкалоз при отсутствии почечной недостаточности;
- ультразвуковое выявление не менее 2-х кистозных поражений в каждой почке или нефрокальциноза;
- ультразвуковое выявление врожденных аномалий почек и мочевыводящих путей (CAKUT) и ХБП ≥ 2 стадии по определению KDIGO
- Форма информированного согласия.
Критерий исключения:
- возраст > 40
- отказаться от участия в исследовании
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Нерандомизированный
- Интервенционная модель: Параллельное назначение
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Патогенные варианты
Варианты, соответствующие биоинформационным критериям приоритетности патогенности в соответствии с рекомендациями ACMG и клиническим фенотипом, а также варианты, уже описанные в литературе, будут определяться как патогенные варианты.
|
Пациенты будут направлены на генетическое консультирование в координационный центр исследования.
Это приведет к окончательному генетическому диагнозу.
|
|
Экспериментальный: Потенциально патогенные варианты
Варианты, соответствующие биоинформационным критериям приоритетности, но, очевидно, не коррелирующие с клиническим фенотипом и ранее не описанные в литературе, будут определяться как потенциально патогенные варианты.
|
Пациенты и члены их семей пройдут тщательное клиническое обследование в координационном центре исследования для определения диагностических показателей предполагаемого заболевания на основании результатов генетического тестирования (обратное фенотипирование).
Клиническое обследование может включать проведение дополнительных клинических и инструментальных исследований, а также другие специализированные консультации.
Это приведет к окончательному генетическому диагнозу в значительной части случаев, которым затем будет предоставлено генетическое консультирование.
|
|
Экспериментальный: Варианты неизвестного значения (ВУС)
Варианты, соответствующие фенотипу, но не соответствующие биоинформационным критериям приоритетности, будут определяться как варианты неопределенной клинической значимости (ВУЗ).
|
Исследователи проведут функциональную оценку с помощью клеток-предшественников почек, полученных из мочи (u-RPC), чтобы установить роль вариантов в определении клинического фенотипа.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Подтверждение генетического диагноза
Временное ограничение: С момента регистрации (генетического тестирования) до даты возврата результатов генетического тестирования (до 6 месяцев)
|
Исследователи оценят роль потенциально патогенных вариантов и вариантов неопределенного клинического значения (ВУЗ) в установлении окончательного генетического диагноза путем повторной оценки пациентов (обратное фенотипирование) или функциональных исследований in vitro. В частности, после получения результатов ЭС многопрофильная команда оценит результаты секвенирования и в конечном итоге запросит дополнительные исследования (например, лабораторные или визуализирующие тесты, специальные консультации и т. д.) пациенту и/или члену его семьи, чтобы найти ранее необнаруженные/незамеченные признаки генетических заболеваний, предполагаемых ES (обратное фенотипирование). Функциональные исследования u-RPC in vitro будут запрошены у определенной группы пациентов. Количество пациентов с окончательным диагнозом, полученным с помощью этих стратегий, будет способствовать общей диагностической скорости рабочего процесса (количество окончательного генетического диагноза/количество пациентов, включенных в исследование). |
С момента регистрации (генетического тестирования) до даты возврата результатов генетического тестирования (до 6 месяцев)
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Идентификация молекулярных путей
Временное ограничение: От регистрации (генетическое тестирование) до последнего визита последнего пациента, по оценкам, до 12 месяцев.
|
Целью исследователей является определение молекулярных путей, которые могут представлять собой потенциальные терапевтические мишени у пациентов, несущих потенциально патогенные варианты. С этой целью исследователи проведут секвенирование одноклеточной РНК на фрагментах биопсии почек пациентов, перенесших диагностическую биопсию почки. После получения внутриклеточного транскриптома отдельных клеток, несущих потенциально патогенные варианты, исследователи сравнит их профиль экспрессии РНК с тем же типом клеток, полученных от немутировавших пациентов. |
От регистрации (генетическое тестирование) до последнего визита последнего пациента, по оценкам, до 12 месяцев.
|
|
Изучите применимость редактирования генов при редких заболеваниях почек.
Временное ограничение: От регистрации (генетическое тестирование) до последнего визита последнего пациента, по оценкам, до 12 месяцев.
|
Исследователи изучат возможность редактирования генов CRISPR/Cas9 при редких заболеваниях почек с помощью u-RPC, полученных от пациентов, несущих патогенные мутации. Чтобы добиться спасения вариантов, вызывающих заболевание, исследователи проведут стабильную коррекцию генетических вариантов, выявленных с помощью подхода редактирования генов CRISPR/Cas9, в u-RPC, выделенном от пациентов, несущих патогенные варианты. |
От регистрации (генетическое тестирование) до последнего визита последнего пациента, по оценкам, до 12 месяцев.
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Оцененный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Патологические процессы
- Урологические заболевания
- Атрибуты болезни
- Почечная недостаточность
- Хроническое заболевание
- Женские урогенитальные заболевания
- Женские мочеполовые заболевания и осложнения беременности
- Урогенитальные заболевания
- Мужские мочеполовые заболевания
- Заболевания почек
- Почечная недостаточность, хроническая
Другие идентификационные номера исследования
- NIKE
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .