Identifikace klinických mikrobiálních druhů a antibiotické rezistence u pacientů s ED s infekcí – je rychlá identifikace možná a přesná?

Výrazného zlepšení včasné a účinné léčby pacientů postižených sepsí lze dosáhnout implementací moderních technologií pro identifikaci škodlivých mikrobiálních druhů a jejich vrozených cílů genetické antibiotické léčby. Náš společný tým plánuje vyřešit tuto potřebu pomocí zařízení Point-of-Care (POC) vybaveného pro identifikaci bakteriálního druhu do 60 minut od rutinního laboratorního odběru krve na pohotovosti nebo jiného odběru vzorků, po kterém následuje cílená analýza jeho vrozených prvky genetické antibiotické rezistence během pouhých 7 hodin. Toto revoluční zlepšení klinického managementu je kritické pro zlepšení výsledků pacientů u nemocného syndromu, který je nejen celosvětově velmi rozšířený, spotřebovává denně obrovské množství lékařských zdrojů, ale u kterého hrozí, že se bude nadále zhoršovat vzhledem k současným praktikám dohledu nad antibiotiky. Včasná cílená terapie (EGDT) je standardem, podle kterého se nyní utvářejí lékařské intervence napříč obory v moderním klinickém prostředí, od traumat a neurochirurgie po kardiologii a infekční onemocnění. Rychlá a přesná diagnostika spojená s agresivní a účinnou intervencí vede k zastavení procesu onemocnění, stejně jako k udržení ekonomicky proveditelné péče a zlepšení dlouhodobé morbidity. Snahu aplikovat EGDT u pacientů s vysokým rizikem systémové infekce, sepse, zahájili před více než deseti lety Rivers a kolegové z oddělení urgentního příjmu. Systematické přístupy k časné identifikaci a intervenci sepse, včetně širokospektrého pokrytí antibiotiky a adekvátní objemové resuscitace, přinesly definitivní zlepšení ve výsledcích pacientů a využití zdrojů zdravotní péče. Bylo zjištěno, že jedním z limitujících faktorů při léčbě sepse v nemocničním prostředí je včasnost identifikace patogenu a zavedení vhodné antimikrobiální terapie. Současným „zlatým standardem“ mikrobiální identifikace sepse je hemokultura, která trvá 3–5 dní pro definitivní identifikaci druhu. Citlivost k antimikrobiálním látkám pro daný organismus je obecně získána ve stejném časovém rámci. V období od odběru vzorku po výsledky kultivace však musí být zajištěno empirické širokospektrální antibiotické pokrytí, často zahrnující více antibiotik, aby byla zajištěna eradikace organismu. Tento návrh si klade za cíl použít testování Point of Care (POC), jak je popsáno v laboratoři vyšetřovatelů, k přesné identifikaci patogenních mikroorganismů u pacientů s podezřením na sepsi do 20 minut od laboratorního odběru krve nebo moči. Rozsah návrhu výzkumníků je proveditelný v tom, že 20 organismů odpovídá za 87 % mikrobiálních infekcí identifikovaných technikami založenými na kultuře ve Sparrow Hospital, což představuje větší oblast Lansingu v Michiganu, a 50 mikroorganismů by představovalo prakticky každý mikrobiální infekční druh ( Khalife, 2011, nepublikovaná data). V předběžných studiích vyšetřovatelé ověřili tento přístup laboratorně zpracovanými vzorky Escherichia coli a Staphylococcus aureus. Výzkumníci nyní vytvářejí panely pro různé typy infekcí a ověřili toto úsilí na více než 30 mikroorganismech. Testování POC bude nyní rozšířeno o další mikroorganismy, se kterými se běžně setkáváme u pacientů se sepsí nebo u pacientů s jinými identifikovatelnými infekčními zdroji. Sekundárně budou geny antimikrobiální rezistence skenovány pomocí funkčního genomického přístupu s vysoce paralelní kvantitativní PCR, jak to provedla laboratoř výzkumníků v předchozí studii zkoumající mikrobiotu prasečího gastrointestinálního traktu.