Identificazione di specie microbiche cliniche e resistenza agli antibiotici nei pazienti con DE che presentano infezione: l'identificazione rapida è possibile e accurata?

Un notevole miglioramento nel trattamento tempestivo ed efficace dei pazienti affetti da sepsi può essere ottenuto con l'implementazione di moderne tecnologie per l'identificazione delle specie microbiche offensive e dei loro obiettivi di trattamento antibiotico genetico innato. Il nostro team di collaborazione sta pianificando di rispondere a questa esigenza utilizzando un dispositivo Point-of-Care (POC) attrezzato per l'identificazione di una specie batterica entro 60 minuti da un normale prelievo di sangue di laboratorio del Pronto Soccorso o altra raccolta di campioni, seguita da un'analisi mirata del suo innato elementi genetici di resistenza agli antibiotici in sole 7 ore. Questo rivoluzionario miglioramento nella gestione clinica è fondamentale per migliorare i risultati dei pazienti per una sindrome patologica che non solo è altamente diffusa in tutto il mondo, consumando quotidianamente un'enorme quantità di risorse mediche, ma che minaccia solo di continuare a peggiorare date le attuali pratiche di gestione degli antibiotici. La terapia precoce orientata all'obiettivo (EGDT) è lo standard in base al quale gli interventi medici sono ora modellati in tutti i campi del contesto clinico moderno, che vanno dal trauma e dalla neurochirurgia alla cardiologia e alle malattie infettive. Diagnosi rapide e accurate, abbinate a interventi aggressivi ed efficaci, sono evidenti per arginare il processo della malattia, nonché per mantenere un'assistenza economicamente fattibile e migliorare la morbilità a lungo termine. Lo sforzo per applicare l'EGDT ai pazienti ad alto rischio di infezione sistemica, sepsi, è stato avviato oltre un decennio fa da Rivers e colleghi nel reparto di emergenza. Approcci sistematici all'identificazione e all'intervento precoci della sepsi, inclusa la copertura antibiotica ad ampio spettro e un'adeguata rianimazione del volume dei fluidi, hanno prodotto miglioramenti definitivi negli esiti dei pazienti e nell'utilizzo delle risorse sanitarie. È stato riconosciuto che uno dei fattori limitanti nel trattamento della sepsi in ambito ospedaliero è la tempestività dell'identificazione del patogeno e l'implementazione di un'appropriata terapia antimicrobica. L'attuale "gold standard" dell'identificazione microbica della sepsi è l'emocoltura, che richiede 3-5 giorni per un'identificazione definitiva della specie. La suscettibilità agli agenti antimicrobici per il dato organismo viene generalmente acquisita entro questo stesso lasso di tempo. Tuttavia, nel periodo che intercorre tra la raccolta del campione e i risultati della coltura, deve essere fornita una copertura antibiotica empirica ad ampio spettro, che spesso coinvolge più antibiotici, per garantire l'eradicazione del microrganismo. Questa proposta mira a utilizzare il test Point of Care (POC), come descritto dal laboratorio dell'investigatos, per identificare accuratamente i microrganismi patogeni nei pazienti con sospetta sepsi entro 20 minuti da un prelievo di sangue di laboratorio o dalla raccolta delle urine. Lo scopo della proposta dei ricercatori è fattibile in quanto 20 organismi rappresentano l'87% delle infezioni microbiche identificate mediante tecniche basate sulla coltura presso lo Sparrow Hospital, che rappresenta la grande area di Lansing, Michigan, e 50 microrganismi rappresenterebbero praticamente ogni specie microbica infettiva ( Khalife, 2011, dati non pubblicati). Negli studi preliminari i ricercatori hanno convalidato questo approccio con campioni elaborati in laboratorio di Escherichia coli e Staphylococcus aureus. I ricercatori ora stanno creando pannelli per molteplici tipi di infezioni e hanno convalidato questi sforzi su oltre 30 microrganismi. I test POC saranno ora ampliati per includere ulteriori microrganismi comunemente riscontrati nei pazienti con sepsi o quelli con altre fonti infettive identificabili. Secondariamente, i geni di resistenza antimicrobica saranno scansionati utilizzando un approccio di genomica funzionale con PCR quantitativa altamente parallela, come eseguito dal laboratorio dei ricercatori in uno studio precedente che esplorava il microbiota del tratto gastrointestinale dei suini.