Identifikace prognostických biomarkerů pro progresi invazivního spinocelulárního karcinomu
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Karlyn Pierson, MAN, RN
- Telefonní číslo: 507-538-1960
- E-mail: pierson.karlyn@mayo.edu
Studijní místa
-
-
Minnesota
-
Rochester, Minnesota, Spojené státy, 55905
- Mayo Clinic in Rochester
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- známý nebo suspektní spinocelulární karcinom plic
- schopen poskytnout souhlas
- mohl již podstoupit bronchoskopii nebo chirurgickou resekci s tkání zachráněnou na Mayo Clinic v Rochesteru
- podstoupí bronchoskopii a chirurgickou resekci na Mayo Clinic Rochester
Kritéria vyloučení:
- nemůže poskytnout souhlas
- těhotná
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Pouze případ
- Časové perspektivy: Budoucí
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Sbírka tkání
Plánujeme prospektivně odebrat 5 bronchoskopických biopsií, 3 ml krve a jeden nádor a přilehlé normální vzorky od 200 kvalifikovaných pacientů, kteří splňují kritéria studie.
Pokud pacient již podstoupil bronchoskopii a má k dispozici vzorky, které byly dříve odebrány a uloženy pro výzkum na Mayo Clinic, použijeme tyto vzorky.
|
Poté extrahujeme DNA z tkáňových řezů a krve a použijeme vlastní cílený sekvenační panel 23 genů ovlivňujících rakovinu s významnými mutacemi u spinocelulárního karcinomu, který jsme vyvinuli k nalezení prognostických biomarkerů.
DNA bude použita v PCR reakci ke generování amplikonů pro přípravu knihovny pomocí protokolu přípravy knihovny Illumina Nextera XT a cíleného sekvenování na sekvenátoru Illumina Hiseq.
Údaje budou zarovnány s HG19 pomocí BWA aligneru a detekce variant provedené pomocí analytických nástrojů Agilent SureCall a GATK.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Počet a typy rekurentních genomických změn hodnocených vlastním cíleným sekvenačním panelem.
Časové okno: 2 roky
|
Cílem této studie je identifikovat a charakterizovat rekurentní genomové změny nalezené u invazivního spinocelulárního karcinomu, které jsou přítomny v prekurzorových epiteliálních tkáních dýchacích cest, ale chybí v normálních tkáních vyšetřovaných ze vzorků odebraných během plicního výkonu.
|
2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic
Publikace a užitečné odkazy
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 15-000548
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .