Identifikation af prognostiske biomarkører for progression af invasivt planocellulært karcinom
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Karlyn Pierson, MAN, RN
- Telefonnummer: 507-538-1960
- E-mail: pierson.karlyn@mayo.edu
Studiesteder
-
-
Minnesota
-
Rochester, Minnesota, Forenede Stater, 55905
- Mayo Clinic in Rochester
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- kendt eller mistænkt planocellulært karcinom i lungen
- i stand til at give samtykke
- kunne allerede have fået en bronkoskopi eller kirurgisk resektion med væv gemt på Mayo Clinic Rochester
- vil gennemgå en bronkoskopi og have en kirurgisk resektion på Mayo Clinic Rochester
Ekskluderingskriterier:
- ude af stand til at give samtykke
- gravid
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kun etui
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Vævssamling
Vi planlægger prospektivt at indsamle 5 bronkoskopiske biopsier, 3 ml blod og en tumor og tilstødende normale prøver fra 200 kvalificerede patienter, der opfylder undersøgelseskriterierne.
Hvis en patient allerede har fået foretaget en bronkoskopi og har prøver til rådighed, som tidligere blev indsamlet og opbevaret til forskning på Mayo Clinic, vil vi bruge disse prøver.
|
Vi vil derefter udtrække DNA fra vævssnit og blod og bruge et tilpasset målrettet sekventeringspanel af 23 cancerdrivergener med signifikante mutationer i planocellulært karcinom, som vi har udviklet for at finde de prognostiske biomarkører.
DNA'et vil blive brugt i en PCR-reaktion til at generere amplikoner til biblioteksforberedelse ved hjælp af Illumina Nextera XT biblioteksforberedelsesprotokol og målrettet sekventering på Illumina Hiseq-sequenceren.
Aflæsningerne vil blive justeret til HG19 ved hjælp af BWA aligner og variantdetektion udført med Agilent SureCall og GATK analytiske værktøjer.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Antal og typer af tilbagevendende genomiske ændringer evalueret af et brugerdefineret målrettet sekventeringspanel.
Tidsramme: 2 år
|
Formålet med denne undersøgelse er at identificere og karakterisere tilbagevendende genomisk ændring fundet i invasivt planocellulært carcinom, som er til stede i precursor-luftvejsepitelvævet, men fraværende i normalt væv undersøgt fra prøver taget under en lungeprocedure.
|
2 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic
Publikationer og nyttige links
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 15-000548
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .