Identifizierung prognostischer Biomarker für das Fortschreiten des invasiven Plattenepithelkarzinoms
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Karlyn Pierson, MAN, RN
- Telefonnummer: 507-538-1960
- E-Mail: pierson.karlyn@mayo.edu
Studienorte
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Minnesota
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Rochester, Minnesota, Vereinigte Staaten, 55905
- Mayo Clinic in Rochester
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- bekanntes oder vermutetes Plattenepithelkarzinom der Lunge
- Zustimmung erteilen können
- hätte bereits eine Bronchoskopie oder chirurgische Resektion mit Gewebe in der Mayo Clinic Rochester erhalten haben können
- wird sich einer Bronchoskopie und einer chirurgischen Resektion in der Mayo Clinic Rochester unterziehen
Ausschlusskriterien:
- Zustimmung nicht erteilen können
- schwanger
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Nur Fall
- Zeitperspektiven: Interessent
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
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Gewebesammlung
Wir planen, prospektiv 5 bronchoskopische Biopsien, 3 ml Blut und einen Tumor sowie benachbarte normale Proben von 200 qualifizierten Patienten zu entnehmen, die die Studienkriterien erfüllen.
Wenn ein Patient bereits eine Bronchoskopie hatte und Proben zur Verfügung hat, die zuvor in der Mayo-Klinik für Forschungszwecke gesammelt und gelagert wurden, werden wir diese Proben verwenden.
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Wir werden dann DNA aus Gewebeschnitten und Blut extrahieren und ein von uns entwickeltes Panel für die zielgerichtete Sequenzierung von 23 Krebstreibergenen mit signifikanten Mutationen im Plattenepithelkarzinom verwenden, um die prognostischen Biomarker zu finden.
Die DNA wird in einer PCR-Reaktion verwendet, um Amplikons für die Bibliotheksvorbereitung unter Verwendung des Illumina Nextera XT-Bibliotheksvorbereitungsprotokolls und der gezielten Sequenzierung auf dem Illumina Hiseq-Sequenzer zu generieren.
Die Reads werden mit dem BWA-Aligner und der Variantenerkennung mit Agilent SureCall und den GATK-Analysetools am HG19 ausgerichtet.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Anzahl und Arten wiederkehrender genomischer Veränderungen, die von einem benutzerdefinierten Targeted-Sequencing-Panel bewertet werden.
Zeitfenster: 2 Jahre
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Ziel dieser Studie ist es, wiederkehrende genomische Veränderungen zu identifizieren und zu charakterisieren, die in invasiven Plattenepithelkarzinomen gefunden werden und in den Vorläufergeweben der Atemwege vorhanden sind, aber in normalen Geweben fehlen, die aus Proben entnommen wurden, die während eines Lungeneingriffs entnommen wurden.
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2 Jahre
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic
Publikationen und hilfreiche Links
Nützliche Links
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Geschätzt)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Geschätzt)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 15-000548
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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