Identificazione di biomarcatori prognostici per la progressione del carcinoma a cellule squamose invasivo
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Karlyn Pierson, MAN, RN
- Numero di telefono: 507-538-1960
- Email: pierson.karlyn@mayo.edu
Luoghi di studio
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Minnesota
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Rochester, Minnesota, Stati Uniti, 55905
- Mayo Clinic in Rochester
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- carcinoma a cellule squamose noto o sospetto del polmone
- in grado di fornire il consenso
- potrebbe aver già subito una broncoscopia o una resezione chirurgica con tessuto salvato presso la Mayo Clinic Rochester
- sarà sottoposto a broncoscopia e a resezione chirurgica presso la Mayo Clinic Rochester
Criteri di esclusione:
- impossibilitato a fornire il consenso
- incinta
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Solo caso
- Prospettive temporali: Prospettiva
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Raccolta dei tessuti
Abbiamo in programma di raccogliere in modo prospettico 5 biopsie broncoscopiche, 3 ml di sangue e un tumore e campioni normali adiacenti da 200 pazienti qualificati che soddisfano i criteri dello studio.
Se un paziente ha già avuto una broncoscopia e dispone di campioni disponibili che sono stati precedentemente raccolti e conservati per la ricerca presso la Mayo Clinic, utilizzeremo tali campioni.
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Quindi estrarremo il DNA da sezioni di tessuto e sangue e utilizzeremo un pannello di sequenziamento mirato personalizzato di 23 geni driver del cancro con mutazioni significative nel carcinoma a cellule squamose che abbiamo sviluppato per trovare i biomarcatori prognostici.
Il DNA verrà utilizzato in una reazione PCR per generare ampliconi per la preparazione della libreria utilizzando il protocollo di preparazione della libreria Illumina Nextera XT e il sequenziamento mirato sul sequenziatore Illumina Hiseq.
Le letture saranno allineate all'HG19 utilizzando l'allineatore BWA e il rilevamento delle varianti eseguito con gli strumenti analitici Agilent SureCall e GATK.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Numero e tipi di alterazioni genomiche ricorrenti valutate da un pannello di sequenziamento mirato personalizzato.
Lasso di tempo: 2 anni
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Lo scopo di questo studio è identificare e caratterizzare le alterazioni genomiche ricorrenti riscontrate nel carcinoma a cellule squamose invasivo che sono presenti nei tessuti epiteliali precursori delle vie aeree ma assenti nei tessuti normali esaminati da campioni prelevati durante una procedura polmonare.
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2 anni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic
Pubblicazioni e link utili
Collegamenti utili
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Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Completamento primario
Completamento dello studio (Effettivo)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stimato)
Primo Inserito
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Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 15-000548
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prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti
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