Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Identifikace prognostických biomarkerů pro progresi invazivního spinocelulárního karcinomu

9. října 2025 aktualizováno: Dennis Wigle, Mayo Clinic
Studie bude využívat retrospektivní i prospektivní sběr dat od pacientů, kteří již podstoupili bronchoskopii a plicní resekci nebo budou mít bronchoskopii a plicní resekci pro spinocelulární karcinom. Výzkumníci plánují prospektivně odebrat 5 bronchoskopických biopsií, 10 ml krve a jeden nádor a přilehlé normální vzorky od 200 kvalifikovaných pacientů, kteří splňují kritéria studie.

Přehled studie

Postavení

Ukončeno

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

Studie bude využívat retrospektivní i prospektivní sběr dat od pacientů, kteří již podstoupili bronchoskopii a plicní resekci nebo budou mít bronchoskopii a plicní resekci pro spinocelulární karcinom. Výzkumníci plánují prospektivně odebrat 5 bronchoskopických biopsií, 10 ml krve a jeden nádor a přilehlé normální vzorky od 200 kvalifikovaných pacientů, kteří splňují kritéria studie. Pokud pacient již podstoupil bronchoskopii a souhlasil s uložením vzorků pro výzkum na Mayo Clinic Rochester, budeme k nim mít přístup pro výzkumnou studii, pokud jsou k dispozici. V opačném případě, pokud pacient již podstoupil operaci a tkáň nebyla uložena pro výzkum, vyšetřovatelé povolí pacientům použití jejich klinických vzorků pro výzkumnou studii. Vyšetřovatelé poté extrahují DNA z tkáňových řezů a krve a použijí vlastní cílený sekvenační panel 23 genů ovlivňujících rakovinu s významnými mutacemi u spinocelulárního karcinomu, které vyvinuli k nalezení prognostických biomarkerů. DNA bude použita v PCR reakci ke generování amplikonů pro přípravu knihovny pomocí protokolu přípravy knihovny Illumina Nextera XT a cíleného sekvenování na sekvenátoru Illumina Hiseq. Odečty budou zarovnány s HG19 pomocí BWA aligneru a detekce variant provedená pomocí analytických nástrojů Agilent SureCall a GATK.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

22

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

  • Spojené státy
    • Minnesota
      • Rochester, Minnesota, Spojené státy, 55905
        • Mayo Clinic in Rochester

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Mayo Clinic pacientů hrudní chirurgie

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • známý nebo suspektní spinocelulární karcinom plic
  • schopen poskytnout souhlas
  • mohl již podstoupit bronchoskopii nebo chirurgickou resekci s tkání zachráněnou na Mayo Clinic v Rochesteru
  • podstoupí bronchoskopii a chirurgickou resekci na Mayo Clinic Rochester

Kritéria vyloučení:

  • nemůže poskytnout souhlas
  • těhotná

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Pouze případ
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Sbírka tkání
Plánujeme prospektivně odebrat 5 bronchoskopických biopsií, 3 ml krve a jeden nádor a přilehlé normální vzorky od 200 kvalifikovaných pacientů, kteří splňují kritéria studie. Pokud pacient již podstoupil bronchoskopii a má k dispozici vzorky, které byly dříve odebrány a uloženy pro výzkum na Mayo Clinic, použijeme tyto vzorky.
Genetický: Extrakce DNA
Poté extrahujeme DNA z tkáňových řezů a krve a použijeme vlastní cílený sekvenační panel 23 genů ovlivňujících rakovinu s významnými mutacemi u spinocelulárního karcinomu, který jsme vyvinuli k nalezení prognostických biomarkerů. DNA bude použita v PCR reakci ke generování amplikonů pro přípravu knihovny pomocí protokolu přípravy knihovny Illumina Nextera XT a cíleného sekvenování na sekvenátoru Illumina Hiseq. Údaje budou zarovnány s HG19 pomocí BWA aligneru a detekce variant provedené pomocí analytických nástrojů Agilent SureCall a GATK.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Počet a typy rekurentních genomických změn hodnocených vlastním cíleným sekvenačním panelem.
Časové okno: 2 roky
Cílem této studie je identifikovat a charakterizovat rekurentní genomové změny nalezené u invazivního spinocelulárního karcinomu, které jsou přítomny v prekurzorových epiteliálních tkáních dýchacích cest, ale chybí v normálních tkáních vyšetřovaných ze vzorků odebraných během plicního výkonu.
2 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Mayo Clinic

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Dennis Wigle, MD, PhD, Mayo Clinic

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Užitečné odkazy

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

8. dubna 2015

Primární dokončení (Aktuální)

23. dubna 2020

Dokončení studie (Aktuální)

23. dubna 2020

Termíny zápisu do studia

První předloženo

10. září 2015

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

11. září 2015

První zveřejněno (Odhadovaný)

15. září 2015

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)

14. října 2025

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

9. října 2025

Naposledy ověřeno

1. října 2025

Více informací

Termíny související s touto studií

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 15-000548

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

produkt vyrobený a vyvážený z USA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Karcinom, skvamózní buňky

Klinické studie na Extrakce DNA

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Paraguay

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit