Genomická analýza peritoneálního mezoteliomu pomocí CGH Arrays
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- chirurgická biopsie peritoneálního nádoru se zmrazenými vzorky
- věk > 18 let
Kritéria vyloučení:
- nepřítomnost peritoneálního mezoteliomu
- nepřítomnost zmrazených vzorků
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Retrospektivní
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Vzorky peritoneálního mezoteliomu
Ve skupině jsou pouze pacienti, u kterých byla po operaci diagnostikována peritoneální mezoteliom. Do této skupiny jsou zahrnuti všichni pacienti. CGH čipy budou realizovány na zmrazených vzorcích (pro komparativní genomickou analýzu). |
Extrakce DNA a RNA bude provedena v univerzitní nemocnici v Lyonu (genomická platforma) pomocí komerčně dostupného kitu.
Procento nádorových buněk bude kontrolováno obarveným řezem před extrakcí.
Čipy CGH budou realizovány na zmrazených vzorcích v Lille (genomická platforma).
Bude použito pole Pangenomic Agilent.
Micro-array obsahuje 180 000 sond.
Analýza bude provedena v Lille (genomická platforma / oddělení bioinformatiky) s Marie Brevet.
Data budou zpracována z log2 transformovaných dat do normalizace metodou WACA.
Variace počtu kopií pak bude identifikována pomocí kruhové binární segmentace.
Variace počtu kopií budou nazývány jako zisk nebo delece podle distribuce poměru log2 a procenta nádorových buněk.
Použití shodné nádorové a normální DNA odstraní polymorfismy počtu kopií.
Budeme konstruovat nekontrolované hierarchické analýzy ke studiu klasifikace peritoneálního mezoteliomu na základě variace počtu kopií
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Mutace BAP1
Časové okno: Den 0
|
Pole CGH
|
Den 0
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- D50828
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .