Analisi genomica del mesotelioma peritoneale mediante array CGH
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- biopsia chirurgica del tumore peritoneale con campioni congelati
- età > 18 anni
Criteri di esclusione:
- assenza di mesotelioma peritoneale
- assenza di campioni congelati
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Retrospettiva
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
|---|---|
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Campioni di mesotelioma peritoneale
Il gruppo ospita solo pazienti che hanno ricevuto la diagnosi di mesotelioma peritoneale dopo l'intervento chirurgico. Tutti i pazienti sono inclusi in questo gruppo. Gli array di CGH saranno realizzati su campioni congelati (per l'analisi genomica comparativa). |
L'estrazione del DNA e dell'RNA verrà eseguita nell'ospedale universitario di Lione (piattaforma genomica) utilizzando kit disponibili in commercio.
La percentuale di cellule tumorali sarà controllata mediante sezioni colorate prima dell'estrazione.
Gli array CGH saranno realizzati su campioni congelati a Lille (piattaforma genomica).
Verrà utilizzato l'array pangenomico Agilent.
Il microarray include 180000 sonde.
L'analisi sarà eseguita a Lille (piattaforma genomica/dipartimento di BioInformatica) con Marie Brevet.
I dati saranno elaborati dai dati log2 trasformati in normalizzazione con il metodo WACA.
Quindi la variazione del numero di copie verrà quindi identificata con la segmentazione binaria circolare.
Le variazioni del numero di copie saranno denominate guadagno o delezione in base alla distribuzione del rapporto log2 e alla percentuale di cellule tumorali.
L'uso di DNA tumorale e normale abbinato eliminerà i polimorfismi del numero di copie.
Costruiremo analisi gerarchiche non supervisionate per studiare la classificazione del mesotelioma peritoneale basata sulla variazione del numero di copie
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Mutazioni BAP1
Lasso di tempo: Giorno 0
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Matrice CGH
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Giorno 0
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio
Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Completamento primario
Completamento dello studio (Effettivo)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stima)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Malattie delle vie respiratorie
- Neoplasie per tipo istologico
- Neoplasie
- Malattie polmonari
- Neoplasie per sede
- Neoplasie, ghiandolari ed epiteliali
- Neoplasie delle vie respiratorie
- Neoplasie toraciche
- Neoplasie polmonari
- Adenoma
- Neoplasie, mesoteliali
- Neoplasie pleuriche
- Mesotelioma
- Mesotelioma, maligno
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- D50828
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