Neurologické projevy arbovirové infekce v Kolumbii

NEAS vede Dr. Carlos Pardo-Villamizar z Univerzity Johnse Hopkinse (JHU) a Dr. Beatriz Parra a Lyda Osorio na Universidad del Valle (UV) v Kolumbii. V této zemi vytvořili síť spolupráce s lékaři, neurology a odborníky na mikrobiologii a epidemiologii. NEAS aktivně nabírá pacienty v sedmi univerzitních nemocnicích v pěti kolumbijských městech. Protokol studie byl schválen v každém ze zúčastněných center.

Prospektivní případová a kontrolní studie NEAS si klade za cíl definovat souvislost mezi expozicí arboviru (Zika, Dengue a Chikungunya) a rozvojem neurologického syndromu u pacientů z Kolumbie, země s endemickým přenosem arboviru. Případy jsou definovány jako jedinci s novým nástupem neurologického syndromu neznámé etiologie, včetně, aniž by byl výčet omezující, encefalitidy, myelitidy, meningitidy, polyneuropatie/Guillain-Barre syndromu a postižení hlavových nervů. Existují dvě věkově odpovídající kontrolní skupiny: 1) kontrola v domácnosti a 2) kontrola s febrilním syndromem neznámé etiologie, který nevykazuje neurologické postižení. Odhadovaná velikost vzorku ve studii je 50 účastníků v každé skupině (případy a kontroly 1 a 2). Doba odběru kompletní velikosti vzorku se pohybuje mezi 12–24 měsíci a závisí na místním výskytu případů.

Každé centrum má tým koordinátorů, který zahrnuje neurologa, lékaře – rezidenta neurologie nebo interního lékařství – a koordinátora výzkumu. Tým pacienty přijaté do centra neustále prověřuje. Pacienti, kteří splňují kritéria pro případy nebo kontroly, jsou osloveni koordinátorem výzkumu, který má na starosti informovat účastníka o studii a vyplnit informovaný souhlas. Poté lékařský tým provede neurologické hodnocení, včetně anamnézy a fyzického vyšetření podle formulářů NEAS. Všem účastníkům se odebírají vzorky krve a moči. Pokud se jako součást standardní péče provádí lumbální punkce, odebírá se také míšní mok. Na základě dostupnosti zdrojů jsou účastníci sledováni každý týden po dobu 4 týdnů a při každé návštěvě je dokončeno klinické hodnocení a odběr vzorků.

Demografické a klinické informace, laboratorní a zobrazovací výsledky jsou uloženy v zabezpečené webové databázi na platformě REDcap se sídlem na JHU. Každé centrum má jedinečnou kombinaci uživatelského jména a hesla pro vstup do databáze a zahrnuje informace o každém účastníkovi v reálném čase. Každé centrum má přístup k obsaženým informacím ze stejného centra a žádný z jiných center. Studijní tým vytvořil standardizované formuláře (formuláře NEAS), které obsahují relevantní informace nezbytné k dosažení cílů této studie a zaručují konzistenci dat. Výsledky laboratorních vyšetření a zobrazení jsou získávány ze zdravotní dokumentace. Týmy JHU a UV provádějí permanentní monitorování databáze.

Poté, co jsou vzorky odebrány, jsou odeslány do základní laboratoře studie umístěné v UV (Dr. Beatriz Parra). Každé středisko bylo vyškoleno ve správné manipulaci, zpracování a expedici vzorků. Jakmile jsou vzorky v základní laboratoři, jsou rozděleny na alikvoty a skladovány. Krev, moč a míšní mok jsou testovány metodou Real Time/Reverse Transkriptase (RT)- Polymease Chain Reaction (PCR) na přítomnost virové RNA (ribonukleové kyseliny) viru Zika a viru dengue. Sérum a míšní mok jsou testovány metodou ELISA na detekci antiflavivirových IgM a IgG. Výsledky jsou sdíleny s místním studijním týmem a lékařským týmem, který se o účastníka stará. Kromě toho jsou alikvoty vzorků odeslány do JHU k dalšímu imunologickému a virologickému posouzení (Dr. Carlos Pardo-Vllamizar).

Byly vytvořeny standardní operační postupy (SOP) pro nábor a souhlas pacienta, zadávání dat REDcap a zpracování a odesílání biologických vzorků. Statistickou analýzu provedou epidemiologové z UV (Dr. Lyda Osorio) a bude zahrnovat frekvenční míry a centrální tendence proměnných. Měření síly asociace bude provedeno pomocí poměru šancí a intervalů spolehlivosti.

DATOVÝ SLOVNÍK

Proměnné jsou rozděleny do tří kategorií: demografické, klinické a laboratorní. Nejrelevantnější proměnné shromážděné ve studii jsou popsány níže.

Demografické proměnné:

• Případ: Definice případu
• Typ kontroly: Definice kontroly
• Splnění kritérií pro zařazení: Splnění kritérií pro zařazení stanovených protokolem
• Pohlaví: Sexuální fenotyp účastníka doložený lékařskými záznamy nebo průkazem totožnosti
• Věk: Věk účastníka dle zdravotní dokumentace nebo průkazu totožnosti
• Rasa: Fenotyp nahlášený účastníkem
• Město bydliště: Místo, kde převážně pobýval v posledních 3 měsících
• Město zprávy: Místo, kde je účastník přijat do studie

Klinické proměnné:

• Celkové příznaky: Klinické projevy odpovídající snížení normálního zdravotního stavu účastníka
• Nástup celkových příznaků: Datum nástupu celkových příznaků
• Neurologické příznaky: Klinické projevy odrážející abnormální fungování nervového systému
• Časový profil: Doba (ve dnech) mezi nástupem celkových příznaků a neurologickými příznaky
• Návštěva endemických oblastí: Historie navštívených oblastí během posledních 4 týdnů s aktuálním místním přenosem viru Zika, Dengue a/nebo Chikungunya
• Minulá lékařská anamnéza: Anamnéza onemocnění diagnostikovaného lékařem nebo zaznamenaného ve zdravotních záznamech během minulého roku
• Rodinná anamnéza: Nemoci, kterými trpí příbuzní prvního nebo druhého stupně pokrevního příbuzenství diagnostikované lékařem nebo zaznamenané ve zdravotních záznamech
• Nedávné očkování: Historie očkování během posledních 4 týdnů před nástupem neurologických příznaků
• Nedávné infekční onemocnění: Anamnéza infekčního onemocnění během posledních 4 týdnů před nástupem neurologických příznaků
• Nedávný chirurgický výkon: Anamnéza velkého chirurgického výkonu během posledních 4 týdnů před nástupem neurologických příznaků
• Datum fyzické zkoušky: Datum, kdy byla fyzická zkouška dokončena studijním týmem
• Psychický stav: Rozsah vlastního/vnějšího vědomí
• Orientace: Uvědomění si času, místa a osoby
• Dysartrie: dysfunkce slovní artikulace sekundární k poškození motorických drah
• Deficit pozornosti: Neschopnost selektivně se soustředit na určitou část informací
• Abnormality hlavových nervů: Kompromis jednoho/více hlavových nervů zjištěných při fyzické zkoušce
• Svalová síla: Množství síly vynaložené svalem proti odporu
• Hluboké šlachové reflexy: Extenze sekundární k hlubokému šlachovému stimulu
• Senzorický deficit: Absence nebo abnormalita v senzorické funkci
• Rombergův příznak: Klinický příznak naznačující senzorickou ataxii, sekundární k abnormalitám hřbetních hřbetů
• Ataxie: Abnormální svalová koordinace při dobrovolných pohybech
• Svalový tonus: Svalový odpor proti pasivnímu pohybu
• Retence moči: Neschopnost úplného vyprázdnění močového měchýře
• Nízký tonus rektálního svalstva: Snížení síly rektálního svěrače
• Abnormální pohyby: Žádné dobrovolné pohyby, bez účelu, sekundární k neurologické dysfunkci
• Respirační selhání: Neschopnost provádět účinnou výměnu plynů nebo udržovat normální hladiny kyslíku a/nebo oxidu uhličitého
• Autonomní dysfunkce: Abnormality v autonomním nervovém systému
• Elektromyografie: Elektrofyziologické studium svalové aktivity
• Elektroencefalogram: Elektrofyziologická studie vedení mozku
• MRI mozku: Zobrazovací studie mozku
• Spinální MRI: Zobrazovací studie míchy
• Rankinovo skóre: Funkční škála pro pacienty s neurologickými poruchami
• ASIA scale: Závažnost míšní léze

Laboratorní proměnné:

• Krevní analýza: Zahrnuje počet bílých krvinek, krevních destiček, hemoglobinu, hematokritu a enzymů jaterních funkcí.
• Analýza míšního moku: Zahrnuje leukocyty, glukózu, proteiny, červené krvinky, oligoklonální proužky, kultury, PCR herpes viru.
• Virologická analýza: Zahrnuje detekci nebo nepřítomnost detekce IgM a IgG pomocí ELISA a RNA pomocí RT-PCR pro virus Zika, virus dengue a virus Chikungunya.