Neurologiske manifestationer af Arbovirus-infektionen i Colombia

NEAS ledes af Dr. Carlos Pardo-Villamizar ved Johns Hopkins University (JHU) og Dr. Beatriz Parra og Lyda Osorio ved Universidad del Valle (UV) i Colombia. De har etableret et samarbejdsnetværk med læger, neurologer og eksperter i mikrobiologi og epidemiologi i det pågældende land. NEAS rekrutterer aktivt patienter på syv universitetsbaserede hospitaler i fem colombianske byer. Protokollen for undersøgelsen er blevet godkendt i hvert af de deltagende centre.

NEAS prospektive case-control undersøgelse har til formål at definere sammenhængen mellem eksponeringen for arbovirus (Zika, Dengue og Chikungunya) og udviklingen af ​​et neurologisk syndrom hos patienter fra Colombia, et land med endemisk overførsel af arbovirus. Tilfældene er defineret som individer, der viser sig med nyopstået neurologisk syndrom af ukendt ætiologi, herunder men ikke begrænset til encephalitis, myelitis, meningitis, polyneuropati/Guillain-Barre syndrom og kranienervepåvirkning. Der er to aldersmatchede kontrolgrupper: 1) husstandskontroller og 2) kontroller med febrilt syndrom af ukendt ætiologi, som ikke udviser neurologisk involvering. Den estimerede stikprøvestørrelse i undersøgelsen er 50 deltagere i hver gruppe (case og kontrol 1 og 2). Tiden til at indsamle hele prøvestørrelsen er mellem 12-24 måneder og afhænger af den lokale forekomst af tilfælde.

Hvert center har et koordinatorteam, der omfatter en neurolog, en læge - beboer i neurologi eller intern medicin - og en forskningskoordinator. Teamet screener løbende de patienter, der er indlagt på centret. De patienter, der opfylder kriterierne for cases eller kontroller, kontaktes af forskningskoordinatoren, som er ansvarlig for at informere deltageren om undersøgelsen og udfylde det informerede samtykke. Derefter udfører det medicinske team den neurologiske evaluering, inklusive historikken og den fysiske undersøgelse i henhold til NEAS-formularerne. Der udtages prøver af blod og urin hos alle deltagere. Hvis der foretages en lumbalpunktur som en del af standarden for pleje, opsamles der også spinalvæske. Baseret på tilgængelighed af ressourcer følges deltagerne hver uge i en 4-ugers periode, og ved hvert besøg gennemføres en klinisk vurdering og prøveindsamling.

Demografiske og kliniske oplysninger, laboratorie- og billeddannelsesresultater gemmes i en sikret webbaseret database i platformen REDcap, baseret på JHU. Hvert center har en unik kombination af et brugernavn og en adgangskode til at komme ind i databasen og inkludere oplysningerne om hver deltager i realtid. Hvert center har adgang til de inkluderede oplysninger fra det samme center og ikke af andre centre. Standardiserede formularer (NEAS-formularer) blev oprettet af undersøgelsesteamet, der inkluderer relevant information, der er nødvendig for at nå målene med denne undersøgelse og garantere datakonsistensen. Laboratorieundersøgelser og billeddiagnostiske resultater hentes fra lægejournalerne. En permanent overvågning af databasen foretages af teamene på JHU og UV.

Efter at prøverne er indsamlet, sendes de til undersøgelsens kernelaboratorium placeret ved UV (Dr. Beatriz Parra). Hvert center er blevet trænet i korrekt håndtering, behandling og forsendelse af prøverne. Når prøverne er i kernelaboratoriet, uddeles de i portioner og opbevares. Blod, urin og spinalvæske testes med Real Time/Reverse Transcriptase (RT) - Polymerase Chain Reaction (PCR) for tilstedeværelsen af ​​viralt RNA (ribonukleinsyre) af Zika-virus og Dengue-virus. Serum og spinalvæske testes med ELISA til påvisning af anti-flavivirus IgM og IgG. Resultaterne deles med det lokale undersøgelseshold og med lægeholdet, der tager sig af deltageren. Derudover sendes alikvoter af prøver til JHU for yderligere immunologiske og virologiske vurderinger (Dr. Carlos Pardo-Vllamizar).

Standard Operative Procedures (SOP) er blevet oprettet for patientrekruttering og -samtykke, REDcap-dataindtastning og bioprøveproces og -forsendelse. Den statistiske analyse vil blive udført af epidemiologer ved UV (Dr. Lyda Osorio), og det vil omfatte frekvensmål og centrale tendensmål for variablerne. Målingen af ​​foreningens styrke vil blive udført ved hjælp af oddsratio og konfidensintervaller.

DATAORDBOG

Variablerne er opdelt i tre kategorier: demografiske, kliniske og laboratoriemæssige. De mest relevante variabler indsamlet i undersøgelsen er beskrevet nedenfor.

Demografiske variabler:

• Case: Case definition
• Kontroltype: Kontroldefinition
• Opfyldelse af inklusionskriterierne: Opfyldelse af inklusionskriterierne fastsat af protokollen
• Køn: Seksuel fænotype af deltageren understøttet af lægejournalen eller ID
• Alder: Deltagerens alder ifølge journalen eller ID
• Race: Fænotype rapporteret af deltageren
• Bopælsby: Sted, hvor der hovedsageligt har været i de sidste 3 måneder
• Rapportby: Sted, hvor deltageren rekrutteres til undersøgelsen

Kliniske variabler:

• Generelle symptomer: Kliniske manifestationer i overensstemmelse med fald i den normale helbredsform hos deltageren
• Debut af generelle symptomer: Dato for debut af generelle symptomer
• Neurologiske symptomer: Kliniske manifestationer, der afspejler en unormal funktion af nervesystemet
• Temporal profil: Tid (i dage) mellem debut af generelle symptomer og neurologiske symptomer
• Besøg i endemiske regioner: Historie om regioner, der har besøgt i de sidste 4 uger med aktuel lokal overførsel af Zika-, Dengue- og/eller Chikungunya-virus
• Tidligere sygehistorie: Historie om en sygdom diagnosticeret af lægen eller rapporteret i journalerne i løbet af det seneste år
• Familiehistorie: Sygdomme lidet af slægtninge i første eller anden slægtskabsgrad, diagnosticeret af lægen eller rapporteret i lægejournalerne
• Nylig vaccination: Anamnese med vaccination inden for de seneste 4 uger før de neurologiske symptomer
• Nylig infektionssygdom: Anamnese med en infektionssygdom inden for de sidste 4 uger før starten af ​​de neurologiske symptomer
• Seneste kirurgiske indgreb: Anamnese med et større kirurgisk indgreb inden for de sidste 4 uger før de neurologiske symptomer.
• Dato for fysisk eksamen: Dato, hvor den fysiske eksamen blev afsluttet af studieholdet
• Mental status: Rækkevidde af egen/ydre bevidsthed
• Orientering: Bevidsthed om tid, sted og person
• Dysartri: Ordartikulationsdysfunktion sekundært til skade på motorveje
• Attention deficit: Manglende evne til selektivt at koncentrere sig om en bestemt del af informationen
• Kranienerverabnormiteter: Kompromittering af en/flere af kranienerverne opdaget ved den fysiske undersøgelse
• Muskelstyrke: Mængden af ​​styrke udført af en muskel mod modstand
• Dybe senereflekser: Forlængelse sekundært til en dyb senestimulus
• Sensorisk underskud: Fravær eller abnormitet i sansefunktionen
• Romberg-tegn: Klinisk tegn, der tyder på sensorisk ataksi, sekundært til abnormiteter i dorsale kolonner
• Ataksi: Unormal muskelkoordination under frivillige bevægelser
• Muskeltonus: Muskelmodstand mod passiv bevægelse
• Urinretention: Manglende evne til at fuldføre blæretømhed
• Lav rektal muskeltonus: Fald i styrken af ​​endetarmens lukkemuskel
• Unormale bevægelser: Ingen frivillige bevægelser, uden formål, sekundært til en neurologisk dysfunktion
• Respirationssvigt: Manglende evne til at udføre en effektiv gasudveksling eller opretholde normale niveauer af ilt og/eller kuldioxid
• Autonom dysfunktion: Abnormiteter i det autonome nervesystem
• Elektromyografi: Elektrofysiologisk undersøgelse af muskelaktiviteten
• Elektroencefalogram: Elektrofysiologisk undersøgelse af hjernens ledning
• Hjerne-MR: Billedundersøgelse af hjernen
• Rygmarvs-MR: Billedundersøgelse af rygmarven
• Rankin score: Funktionel skala for patienter med neurologiske lidelser
• ASIA-skala: Sværhedsgrad af rygmarvslæsion

Laboratorievariable:

• Blodanalyse: Inkluder antallet af hvide blodlegemer, blodplader, hæmoglobin, hæmatokrit og leverfunktionsenzymer.
• Spinalvæskeanalyse: Inkluderer leukocytter, glucose, proteiner, røde blodlegemer, oligoklonale bånd, kulturer, herpesvirus PCR.
• Virologisk analyse: Inkluderer påvisning eller fravær af påvisning af IgM og IgG ved ELISA og RNA ved RT-PCR for Zika-virus, Dengue-virus og Chikungunya-virus.