Sekvenování celého exomu a sekvenování celého genomu pro neimunní fetální/neonatální hydropsy
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Huda B Al-Kouatly, MD
- Telefonní číslo: 215-955-9200
- E-mail: Huda.Al-kouatly@jefferson.edu
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Stephanie M Rice, MS
- E-mail: stephanie.rice@jefferson.edu
Studijní místa
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Spojené státy, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Budou platit následující kritéria pro zařazení:
- Fetální hydrops identifikovaný kdykoli v těhotenství po prvním trimestru
- Rodiče plánují pokračovat s amniocentézou jako rutinním vyšetřením hydropsu.
- Oba rodiče jsou k dispozici pro odběr krve
- Normální CMA a normální karyotyp, pokud se provádí
- Negativní vyšetření na parvovirus B19, cytomegalovirus, toxoplazmózu a syfilis
- Negativní vyšetření fetomaternálního krvácení jako příčina hydropsu U případů neonatálního hydropsu nebudou kritéria pro invazivní prenatální testování vyžadována, protože postnatální vzorek krve od hydropického dítěte bude zdrojem probandové DNA.
Budou platit následující kritéria vyloučení:
- Microarray byl abnormální nebo karyotyp byl abnormální
- Hydrops způsobený vrozenou infekcí
- Fetomaternální krvácení bylo dokumentovanou etiologií hydropsu
- Rodičovskou DNA nelze získat ani pro jednoho z rodičů
- K početí bylo použito dárcovské vajíčko nebo dárcovské spermie
- Plod/kojenec s diagnózou lysozomálního střádavého onemocnění
- Těhotná žena nebo otec dítěte mladší 16 let
- Hydrops byl diagnostikován současně s intrauterinním zánikem plodu
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Plody
DNA získaná ze vzorků plodové vody
|
Sekvenování celého exomu (WES) poskytuje podrobnější informace prostřednictvím většího rozlišení, identifikuje změny jednoho páru bází a malé inzerce a delece.
WES provádí sekvenování exonů kódujících protein, které jsou obsaženy v 1-2 % genomu, ale tvoří přes 85 % všech známých patogenních mutací.
Whole Genome Sequencing (WGS) se v posledních letech objevilo jako diagnostický nástroj, který sekvenuje celý genom a dokáže zachytit inzerce nebo delece bází, strukturní varianty a variace jednotlivých nukleotidů v intronu.
|
|
Novorozenci
DNA získaná ze vzorků krve novorozenců
|
Sekvenování celého exomu (WES) poskytuje podrobnější informace prostřednictvím většího rozlišení, identifikuje změny jednoho páru bází a malé inzerce a delece.
WES provádí sekvenování exonů kódujících protein, které jsou obsaženy v 1-2 % genomu, ale tvoří přes 85 % všech známých patogenních mutací.
Whole Genome Sequencing (WGS) se v posledních letech objevilo jako diagnostický nástroj, který sekvenuje celý genom a dokáže zachytit inzerce nebo delece bází, strukturní varianty a variace jednotlivých nukleotidů v intronu.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Identifikujte známé poruchy jednoho genu, které by nebyly detekovány pomocí microarray, jako příčinu neimunitního hydropsu plodu provedením sekvenování celého exomu (WES)
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
|
Identifikujte nové genetické poruchy spojené s neimunitním hydropsem
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Vyhodnoťte přírůstkovou hodnotu sekvenování celého genomu (WGS) při hodnocení hydropsu plodu, když je WES negativní
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
|
Raději informujte rodiče o etiologii hydropsu, zvláště pokud si přejí následné těhotenství
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- IRB18D.728
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .