Hele exome-sekventering og hele genom-sekventering for ikke-immune føtale/neonatale hydrops
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Huda B Al-Kouatly, MD
- Telefonnummer: 215-955-9200
- E-mail: Huda.Al-kouatly@jefferson.edu
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Stephanie M Rice, MS
- E-mail: stephanie.rice@jefferson.edu
Studiesteder
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Forenede Stater, 19107
- Thomas Jefferson University
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Følgende inklusionskriterier vil gælde:
- Føtale hydrops identificeret når som helst i graviditeten efter første trimester
- Forældre planlægger at fortsætte med fostervandsprøver som en rutinemæssig oparbejdning af hydrops.
- Begge forældre er tilgængelige for blodprøvetagning
- Normal CMA og normal karyotype, hvis udført
- Negativ oparbejdning for Parvovirus B19, cytomegalovirus, toxoplasmose og syfilis
- Negativ føtomaternel blødning oparbejdning som årsag til hydrops I tilfælde af neonatal hydrops vil kriterierne for invasiv prænatal testning ikke være påkrævet, da en postnatal blodprøve fra det hydropiske spædbarn vil være kilden til proband DNA.
Følgende eksklusionskriterier vil gælde:
- Microarray var unormal, eller karyotype var unormal
- Hydrops forårsaget af medfødt infektion
- Føtomaternal blødning var en dokumenteret ætiologi for hydrops
- Forældre-DNA kan ikke opnås for nogen af forældrene
- Donoræg eller donorsæd blev brugt til undfangelse
- Foster/Spædbarn diagnosticeret med lysosomal opbevaringssygdom
- Gravid kvinde eller far til barnet under 16 år
- Hydrops blev diagnosticeret samtidig med intrauterin føtal død
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Fostre
DNA opnået fra fostervandsprøver
|
Whole exome Sequencing (WES) giver mere detaljeret information gennem større opløsning, identifikation af enkelte basepar ændringer og små indsættelser og sletninger.
WES udfører sekventering på de proteinkodende exoner, som er indeholdt i 1-2 % af genomet, men udgør over 85 % af alle kendte patogene mutationer.
Whole Genome Sequencing (WGS) er dukket op i de senere år som et diagnostisk værktøj, der sekvenserer hele genomet og kan opfange insertioner eller deletioner af baser, strukturelle varianter og introniske enkeltnukleotidvariationer.
|
|
Nyfødte
DNA opnået fra neonatale blodprøver
|
Whole exome Sequencing (WES) giver mere detaljeret information gennem større opløsning, identifikation af enkelte basepar ændringer og små indsættelser og sletninger.
WES udfører sekventering på de proteinkodende exoner, som er indeholdt i 1-2 % af genomet, men udgør over 85 % af alle kendte patogene mutationer.
Whole Genome Sequencing (WGS) er dukket op i de senere år som et diagnostisk værktøj, der sekvenserer hele genomet og kan opfange insertioner eller deletioner af baser, strukturelle varianter og introniske enkeltnukleotidvariationer.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Identificer kendte enkeltgenforstyrrelser, der ikke ville blive opdaget af mikroarray som årsag til ikke-immun føtal hydrops ved at udføre hel exome-sekventering (WES)
Tidsramme: 5 år
|
5 år
|
|
Identificer nye genetiske lidelser forbundet med ikke-immune hydrops
Tidsramme: 5 år
|
5 år
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Evaluer den trinvise værdi af helgenomsekventering (WGS) i evalueringen af føtale hydrops, når WES er negativ
Tidsramme: 5 år
|
5 år
|
|
Det er bedre at rådgive forældrene om ætiologien af hydrops, især hvis de ønsker en efterfølgende graviditet
Tidsramme: 5 år
|
5 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- IRB18D.728
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .