Sequenziamento dell'intero esoma e sequenziamento dell'intero genoma per idrope fetale/neonatale non immune
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Huda B Al-Kouatly, MD
- Numero di telefono: 215-955-9200
- Email: Huda.Al-kouatly@jefferson.edu
Backup dei contatti dello studio
- Nome: Stephanie M Rice, MS
- Email: stephanie.rice@jefferson.edu
Luoghi di studio
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Pennsylvania
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Philadelphia, Pennsylvania, Stati Uniti, 19107
- Thomas Jefferson University
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-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Saranno applicati i seguenti criteri di inclusione:
- Idrope fetale identificata in qualsiasi momento della gravidanza dopo il primo trimestre
- I genitori stanno pianificando di procedere con l'amniocentesi come esame di routine per l'idrope.
- Entrambi i genitori sono disponibili per il prelievo di campioni di sangue
- APLV normale e cariotipo normale se eseguito
- Valutazione negativa per parvovirus B19, citomegalovirus, toxoplasmosi e sifilide
- Valutazione negativa dell'emorragia fetomaterna come causa di idrope Per i casi di idrope neonatale, i criteri per il test prenatale invasivo non saranno richiesti in quanto un campione di sangue postnatale dal bambino idropico sarà la fonte del DNA probando.
Saranno applicati i seguenti criteri di esclusione:
- Il microarray era anormale o il cariotipo era anormale
- Idrope causata da infezione congenita
- L'emorragia fetomaterna era un'eziologia documentata per l'idrope
- Il DNA parentale non può essere ottenuto per nessuno dei due genitori
- Per il concepimento sono stati utilizzati ovuli o sperma di donatori
- Feto/bambino con diagnosi di malattia da accumulo lisosomiale
- Donna incinta o padre del bambino di età inferiore ai 16 anni
- L'idrope è stata diagnosticata in concomitanza con la morte fetale intrauterina
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Prospettiva
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Feti
DNA ottenuto da campioni di liquido amniotico
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Il sequenziamento dell'intero esoma (WES) fornisce informazioni più dettagliate attraverso una maggiore risoluzione, identificando le modifiche di una singola coppia di basi e piccole inserzioni ed eliminazioni.
WES esegue il sequenziamento sugli esoni codificanti proteine, che sono contenuti nell'1-2% del genoma ma costituiscono oltre l'85% di tutte le mutazioni patogene conosciute.
Il Whole Genome Sequencing (WGS) è emerso negli ultimi anni come uno strumento diagnostico che sequenzia l'intero genoma e può rilevare inserzioni o delezioni di basi, varianti strutturali e variazioni introniche di singolo nucleotide.
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Neonati
DNA ottenuto da campioni di sangue neonatale
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Il sequenziamento dell'intero esoma (WES) fornisce informazioni più dettagliate attraverso una maggiore risoluzione, identificando le modifiche di una singola coppia di basi e piccole inserzioni ed eliminazioni.
WES esegue il sequenziamento sugli esoni codificanti proteine, che sono contenuti nell'1-2% del genoma ma costituiscono oltre l'85% di tutte le mutazioni patogene conosciute.
Il Whole Genome Sequencing (WGS) è emerso negli ultimi anni come uno strumento diagnostico che sequenzia l'intero genoma e può rilevare inserzioni o delezioni di basi, varianti strutturali e variazioni introniche di singolo nucleotide.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Lasso di tempo |
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Identificare i disturbi noti di un singolo gene che non verrebbero rilevati dal microarray come causa di idrope fetale non immune eseguendo il sequenziamento dell'intero esoma (WES)
Lasso di tempo: 5 anni
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5 anni
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Identificare nuove malattie genetiche associate all'idrope non immune
Lasso di tempo: 5 anni
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5 anni
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Lasso di tempo |
|---|---|
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Valutare il valore incrementale del sequenziamento dell'intero genoma (WGS) nella valutazione dell'idrope fetale quando WES è negativo
Lasso di tempo: 5 anni
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5 anni
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Meglio consigliare i genitori sull'eziologia dell'idrope soprattutto se desiderano una gravidanza successiva
Lasso di tempo: 5 anni
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5 anni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
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Completamento primario
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Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
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Primo Inserito
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Ultimo aggiornamento pubblicato
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Ultimo verificato
Ultimo verificato
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Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
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- IRB18D.728
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