- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT03911531
Sekvenování celého exomu a sekvenování celého genomu pro neimunní fetální/neonatální hydropsy
4. září 2025 aktualizováno: Huda Al-Kouatly, Thomas Jefferson University
Stručné shrnutí: Neimunitní hydrops fetalis (NIHF) je potenciálně smrtelný stav charakterizovaný abnormální akumulací tekutiny ve dvou nebo více kompartmentech plodu.
K NIHF může vést řada etiologií a základní příčina zůstává často nejasná [1].
Současný standard genetického diagnostického testování zahrnuje fetální karyotyp a chromozomální microarray (CMA) s možností provádět testování jednoho genu na amniocytech odebraných amniocentézou (2).
Velká podskupina příčin NIHF zahrnuje poruchy jednoho genu, které nejsou diagnostikovány standardním genetickým vyšetřením pro hydrops.
V současné době je téměř 1 z 5 případů NIHF definován jako idiopatický, což znamená, že neexistuje žádná identifikovaná etiologie (2).
Vyšetřovatelé se domnívají, že je to proto, že příčiny NIHF nejsou zcela prozkoumány, konkrétně poruchy jednoho genu.
Naše výzkumná studie si klade za cíl zvýšit diagnostický výtěžek prováděním sekvenování celého exomu (WES) a sekvenování celého genomu (WGS) u prenatálních a neonatálních případů NIHF, když je standardní genetické testování negativní, identifikuje známé a nové geny, a poskytuje tak rodinám životně důležité informace týkající se specifická diagnóza a riziko pro budoucí těhotenství.
Vyšetřovatelé plánují provést WES jako počáteční diagnostický test.
Pokud je WES negativní, pak vyšetřovatelé přistoupí k provedení WGS.
Přehled studie
Postavení
Nábor
Detailní popis
Toto je návrh prospektivní kohortové studie pro plody nebo novorozence postižené NIHF.
Budou identifikována trojice těhotenství matka-otec-plod komplikovaná idiopatickým neimunitním hydropsem plodu.
Těmto pacientkám bude konzultovat specialista na mateřsko-fetální medicínu, jak by bylo běžné.
V rámci rutinního vyšetření bude doporučena amniocentéza pro karyotyp, CMA a infekční vyšetření.
Amniocentézu provede specialista na mateřsko-fetální medicínu odesílající instituce.
Pacientovi bude také nabídnuto genetické poradenství (rutina).
Subjektům bude nabídnuta registrace, jakmile budou splněna kritéria pro zařazení.
Po zařazení do studie budou odebrány následující vzorky: (1) mateřská krev (2) otcovská krev, (3) fetální DNA izolovaná z amniocytů (4) novorozenecká krev, když je doporučení provedeno postnatálně.
Výsledky WES budou oznámeny genetickému poradci, který se věnuje studii.
Rodiče budou kontaktováni genetickým poradcem a poradí se s nálezy, zda byly pozitivní nebo negativní.
Výsledek bude také sdělen pacientovu primárnímu poskytovateli MFM nebo pediatrovi a primární poskytovatel provede příslušné doporučení ke specialistům na dětskou genetiku.
V případech, kdy není identifikována žádná genetická porucha, bude vzorek uložen a následně bude provedeno sekvenování celého genomu.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Odhadovaný)
55
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: Huda B Al-Kouatly, MD
- Telefonní číslo: 215-955-9200
- E-mail: Huda.Al-kouatly@jefferson.edu
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Stephanie M Rice, MS
- E-mail: stephanie.rice@jefferson.edu
Studijní místa
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Spojené státy, 19107
- Nábor
- Thomas Jefferson University
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
12 let až 51 let (Dítě, Dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Pacienti se budou rekrutovat z řad lékařů MFM, pediatrů a neonatologů.
Popis
Budou platit následující kritéria pro zařazení:
- Fetální hydrops identifikovaný kdykoli v těhotenství po prvním trimestru
- Rodiče plánují pokračovat s amniocentézou jako rutinním vyšetřením hydropsu.
- Oba rodiče jsou k dispozici pro odběr krve
- Normální CMA a normální karyotyp, pokud se provádí
- Negativní vyšetření na parvovirus B19, cytomegalovirus, toxoplazmózu a syfilis
- Negativní vyšetření fetomaternálního krvácení jako příčina hydropsu U případů neonatálního hydropsu nebudou kritéria pro invazivní prenatální testování vyžadována, protože postnatální vzorek krve od hydropického dítěte bude zdrojem probandové DNA.
Budou platit následující kritéria vyloučení:
- Microarray byl abnormální nebo karyotyp byl abnormální
- Hydrops způsobený vrozenou infekcí
- Fetomaternální krvácení bylo dokumentovanou etiologií hydropsu
- Rodičovskou DNA nelze získat ani pro jednoho z rodičů
- K početí bylo použito dárcovské vajíčko nebo dárcovské spermie
- Plod/kojenec s diagnózou lysozomálního střádavého onemocnění
- Těhotná žena nebo otec dítěte mladší 16 let
- Hydrops byl diagnostikován současně s intrauterinním zánikem plodu
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Plody
DNA získaná ze vzorků plodové vody
|
Sekvenování celého exomu (WES) poskytuje podrobnější informace prostřednictvím většího rozlišení, identifikuje změny jednoho páru bází a malé inzerce a delece.
WES provádí sekvenování exonů kódujících protein, které jsou obsaženy v 1-2 % genomu, ale tvoří přes 85 % všech známých patogenních mutací.
Whole Genome Sequencing (WGS) se v posledních letech objevilo jako diagnostický nástroj, který sekvenuje celý genom a dokáže zachytit inzerce nebo delece bází, strukturní varianty a variace jednotlivých nukleotidů v intronu.
|
|
Novorozenci
DNA získaná ze vzorků krve novorozenců
|
Sekvenování celého exomu (WES) poskytuje podrobnější informace prostřednictvím většího rozlišení, identifikuje změny jednoho páru bází a malé inzerce a delece.
WES provádí sekvenování exonů kódujících protein, které jsou obsaženy v 1-2 % genomu, ale tvoří přes 85 % všech známých patogenních mutací.
Whole Genome Sequencing (WGS) se v posledních letech objevilo jako diagnostický nástroj, který sekvenuje celý genom a dokáže zachytit inzerce nebo delece bází, strukturní varianty a variace jednotlivých nukleotidů v intronu.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Identifikujte známé poruchy jednoho genu, které by nebyly detekovány pomocí microarray, jako příčinu neimunitního hydropsu plodu provedením sekvenování celého exomu (WES)
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
|
Identifikujte nové genetické poruchy spojené s neimunitním hydropsem
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Vyhodnoťte přírůstkovou hodnotu sekvenování celého genomu (WGS) při hodnocení hydropsu plodu, když je WES negativní
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
|
Raději informujte rodiče o etiologii hydropsu, zvláště pokud si přejí následné těhotenství
Časové okno: 5 let
|
5 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Huda B Al-Kouatly, MD, Thomas Jefferson University
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Whybra C, Mengel E, Russo A, Bahlmann F, Kampmann C, Beck M, Eich E, Mildenberger E. Lysosomal storage disorder in non-immunological hydrops fetalis (NIHF): more common than assumed? Report of four cases with transient NIHF and a review of the literature. Orphanet J Rare Dis. 2012 Nov 8;7:86. doi: 10.1186/1750-1172-7-86.
- Lionel AC, Costain G, Monfared N, Walker S, Reuter MS, Hosseini SM, Thiruvahindrapuram B, Merico D, Jobling R, Nalpathamkalam T, Pellecchia G, Sung WWL, Wang Z, Bikangaga P, Boelman C, Carter MT, Cordeiro D, Cytrynbaum C, Dell SD, Dhir P, Dowling JJ, Heon E, Hewson S, Hiraki L, Inbar-Feigenberg M, Klatt R, Kronick J, Laxer RM, Licht C, MacDonald H, Mercimek-Andrews S, Mendoza-Londono R, Piscione T, Schneider R, Schulze A, Silverman E, Siriwardena K, Snead OC, Sondheimer N, Sutherland J, Vincent A, Wasserman JD, Weksberg R, Shuman C, Carew C, Szego MJ, Hayeems RZ, Basran R, Stavropoulos DJ, Ray PN, Bowdin S, Meyn MS, Cohn RD, Scherer SW, Marshall CR. Improved diagnostic yield compared with targeted gene sequencing panels suggests a role for whole-genome sequencing as a first-tier genetic test. Genet Med. 2018 Apr;20(4):435-443. doi: 10.1038/gim.2017.119. Epub 2017 Aug 3.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Raymond M, Critchlow E, Rice SM, Wodoslawsky S, Berger SI, Hegde M, Empey PE, Al-Kouatly HB. Fetal pharmacogenomics: A promising addition to complex neonatal care. Mol Genet Metab. 2022 Sep-Oct;137(1-2):140-145. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.08.002. Epub 2022 Aug 12.
- Society for Maternal-Fetal Medicine (SMFM); Norton ME, Chauhan SP, Dashe JS. Society for maternal-fetal medicine (SMFM) clinical guideline #7: nonimmune hydrops fetalis. Am J Obstet Gynecol. 2015 Feb;212(2):127-39. doi: 10.1016/j.ajog.2014.12.018. Epub 2014 Dec 31.
- Rice SM, Varotsis DF, Wodoslawsky S, Critchlow E, Liu R, McLaren RA Jr, Makhamreh MM, Firman B, Berger SI, Al-Kouatly HB. Prenatal Phenotype of Alkuraya-Kucinskas Syndrome: A Novel Case and Systematic Literature Review. Prenat Diagn. 2024 Oct;44(11):1381-1397. doi: 10.1002/pd.6637. Epub 2024 Sep 3.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
15. ledna 2019
Primární dokončení (Odhadovaný)
30. června 2028
Dokončení studie (Odhadovaný)
31. prosince 2028
Termíny zápisu do studia
První předloženo
9. dubna 2019
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
9. dubna 2019
První zveřejněno (Aktuální)
11. dubna 2019
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)
11. září 2025
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
4. září 2025
Naposledy ověřeno
1. listopadu 2024
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- IRB18D.728
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
ANO
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Celé sekvenování Exome
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux; Plateforme... a další spolupracovníciDokončenoSarkom měkkých tkání | Kolorektální karcinomFrancie
-
Xiaofan ZhuDostupnýFanconiho anémie | Autozomální nebo pohlavně vázané recesivní genetické onemocnění | Selhání krvetvorby kostní dřeně, mnohočetné vrozené vady a náchylnost k neoplastickým onemocněním. | Udržování krvetvorby.Čína
-
Sensor Technology for DeafblindRussian RetinaFondNáborOční nemoci | Retinitis PigmentosaRusko
-
University of North Carolina, Chapel HillNational Human Genome Research Institute (NHGRI); East Carolina University; Mission...DokončenoNeuromuskulární onemocnění | Poruchy pohybu | Intelektuální postižení | Poruchou autistického spektra | Mikrocefalie | Ztráta sluchu | Genetické onemocnění | Vrozené poruchy metabolismu | Epilepsie; Záchvat | Malformace mozku | Hypotonie | Zpoždění vývoje | Chromozomová abnormalita | Dysmorfní vlastnosti | Kosterní dysplazie a další podmínkySpojené státy
-
Tianjin Medical University Second HospitalNeznámýSolidní nádor, dospělýČína
-
University Hospital, BordeauxNáborVrozená srdeční chorobaFrancie
-
Dr. Rebecca SchuleGerman Federal Ministry of Education and Research; German Center for Neurodegenerative...NáborDědičná spastická paraplegieRakousko, Německo, Itálie
-
Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine InstituteNábor
-
Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine InstituteBrain & Behavior Research FoundationZatím nenabírámeKatatonie
-
University Hospital, AntwerpUniversitaire Ziekenhuizen KU Leuven; KU Leuven; Universiteit AntwerpenNábor