Integrativní osobní profilování Omics pro monitorování dynamických molekulárních fenotypů během doplňování vláken
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Typ studie
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Zápis
Fáze
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
California
-
Stanford, California, Spojené státy, 94304
- Stanford University
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Dobrý celkový zdravotní stav
Kritéria vyloučení:
- Hladina cukru v krvi nalačno > 126 mg/dl
- Triglyceridy > 400 mg/dl
- Nekontrolovaná hypertenze
- Cévní onemocnění
- Chronické zánětlivé stavy
- Závažné orgánové onemocnění
- Silné užívání alkoholu
- Těhotenství/kojení
- Předchozí bariatrická operace
- Aktivní psychiatrické onemocnění
- Použití léků, o kterých je známo, že ovlivňují metabolismus sacharidů nebo lipidů
- Aktivní porucha příjmu potravy
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Základní věda
- Přidělení: N/A
- Intervenční model: Sekvenční přiřazení
- Maskování: Singl
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Mapování změn mikroflóry v reakci na prebiotický zásah
Časové okno: 3 roky
|
Bude vypracována podrobná mapa mikrobů a změn exprese mikrobiálních genů během intervence. Komplexita mikroflóry ve vzorcích stolice bude určena metagenomickým sekvenováním pomocí brokovnice. Nové mikroby a genové dráhy budou identifikovány de novo sestavením celých fekálních metagenomů. |
3 roky
|
|
Změny lipidového profilu v reakci na prebiotickou intervenci
Časové okno: 3 roky
|
Analýza změn v lipidovém profilu účastníků prebiotické intervence.
Měřené lipidy v mg/dl zahrnují celkový cholesterol, LDL cholesterol, HDL cholesterol a triglyceridy.
|
3 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Komplexní metagenomový profil během prebiotické intervence
Časové okno: 3 roky
|
Budou stanoveny změny v profilu metagenomu hostitele (člověka) během prebiotické intervence.
Sekvence DNA stolice se analyzují pomocí potrubí Humann2 a Metaphlan, aby se vytvořily hodnoty pokrytí drah, početnost genových rodin a početnost taxonů {Franzosa, 2018}.
Ty jsou mapovány do databáze Human Microbiome Project pro srovnání.
|
3 roky
|
|
Komplexní transkriptomový profil během prebiotické intervence
Časové okno: 3 roky
|
Budou stanoveny změny v profilu transkriptomu hostitele (člověka) během prebiotické intervence.
RNA izolovaná z odečtených vzorků PBMC se porovná s hg38 pomocí programu Spliced Transscripts Alignment to a Reference (STAR).
Množství transkriptů se vypočítá pomocí RNA-Seq pomocí Expectation Maximization (RSEM).
Normalizace transkriptové frekvence a párové statistiky měřící rozdíly v transkriptové frekvenci mezi časovými body jsou vypočteny pomocí softwarového balíčku pro R od Bioconductor (DESeq2).
|
3 roky
|
|
Komplexní metabolomový profil během prebiotické intervence
Časové okno: 3 roky
|
Budou stanoveny změny v hostitelském (lidském) metabolomovém profilu během prebiotické intervence.
Plazmatické metabolity se měří na kolonách hmotnostních spektrometrů (HILIC a RPLC separace v pozitivním i negativním ionizačním módu).
MetID a naše data MS/MS se používají k identifikaci 12 740 metabolitů s úrovněmi spolehlivosti od 1 do 3, kde 1 odpovídá MS/MS, retenčnímu času a m/z standardům na naší platformě, 2 má MS/MS a m/z odpovídá z databáze a 3 odpovídá m/z databáze.
|
3 roky
|
|
Komplexní cytokinový profil během prebiotické intervence
Časové okno: 3 roky
|
Budou stanoveny změny cytokinového profilu hostitele (člověka) během prebiotické intervence.
Cytokiny jsou profilovány pomocí systému profilování cytokinů Luminex xMAP ve Stanford Human Immune Monitoring Center.
To zahrnuje připojení protilátek specifických pro cytokiny na kuličky pomocí záchytné molekuly.
Fluorescenční molekuly jsou připojeny k cytokinům a fluorescence se používá jako míra hojnosti cytokinů.
|
3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Aktuální)
Primární dokončení
Dokončení studie (Aktuální)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 1636
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .