Integratives persönliches Omics-Profiling zur Überwachung dynamischer molekularer Phänotypen während der Faserergänzung
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Einschreibung
Phase
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
-
California
-
Stanford, California, Vereinigte Staaten, 94304
- Stanford University
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Guter allgemeiner Gesundheitszustand
Ausschlusskriterien:
- Nüchternblutzucker >126 mg/dl
- Triglyceride >400 mg/dL
- Unkontrollierter Bluthochdruck
- Gefässkrankheit
- Chronisch entzündliche Erkrankungen
- Schwere Organerkrankung
- Starker Alkoholkonsum
- Schwangerschaft/Stillzeit
- Vorherige bariatrische Operation
- Aktive psychiatrische Erkrankung
- Verwendung von Medikamenten, von denen bekannt ist, dass sie den Kohlenhydrat- oder Fettstoffwechsel beeinflussen
- Aktive Essstörung
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Grundlegende Wissenschaft
- Zuteilung: N / A
- Interventionsmodell: Sequenzielle Zuweisung
- Maskierung: Single
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Kartierung von Veränderungen der Mikrobiota als Reaktion auf präbiotische Eingriffe
Zeitfenster: 3 Jahre
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Eine detaillierte Karte von Mikroben und Änderungen der mikrobiellen Genexpression während des Eingriffs wird entwickelt. Die Mikrobiota-Komplexität in Stuhlproben wird durch metagenomische Sequenzierung mit Schrotflinte bestimmt. Neuartige Mikroben und Genwege werden durch De-novo-Assemblierung ganzer fäkaler Metagenome identifiziert. |
3 Jahre
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Veränderungen des Lipidprofils als Reaktion auf eine präbiotische Intervention
Zeitfenster: 3 Jahre
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Analyse von Veränderungen im Lipidprofil der Teilnehmer der präbiotischen Intervention.
Zu den gemessenen Lipiden in mg/dl gehören Gesamtcholesterin, LDL-Cholesterin, HDL-Cholesterin und Triglyceride.
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3 Jahre
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Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Umfassendes Metagenomprofil während einer präbiotischen Intervention
Zeitfenster: 3 Jahre
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Änderungen im Metagenomprofil des Wirts (Mensch) während des präbiotischen Eingriffs werden bestimmt.
Stuhl-DNA-Sequenzen werden mithilfe der Humann2- und Metaphlan-Pipelines analysiert, um Werte für die Signalwegabdeckung, die Häufigkeit von Genfamilien und die Häufigkeit von Taxa zu ermitteln {Franzosa, 2018}.
Diese werden zur Ausrichtung auf die Datenbank des Human Microbiome Project abgebildet.
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3 Jahre
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Umfassendes Transkriptomprofil während einer präbiotischen Intervention
Zeitfenster: 3 Jahre
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Änderungen im Transkriptomprofil des Wirts (Mensch) während des präbiotischen Eingriffs werden bestimmt.
Aus PBMC-Proben isolierte RNA-Lesevorgänge werden mithilfe des Programms „Spliced Transcripts Alignment to a Reference“ (STAR) an hg38 ausgerichtet.
Die Transkripthäufigkeit wird mithilfe von RNA-Seq by Expectation Maximization (RSEM) berechnet.
Die Normalisierung der Transkripthäufigkeit und paarweise Statistiken zur Messung der Unterschiede in der Transkripthäufigkeit zwischen Zeitpunkten werden mit dem Softwarepaket für R von Bioconductor (DESeq2) berechnet.
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3 Jahre
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Umfassendes Metabolomprofil während einer präbiotischen Intervention
Zeitfenster: 3 Jahre
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Änderungen im Metabolomprofil des Wirts (Mensch) während der präbiotischen Intervention werden bestimmt.
Plasmametaboliten werden in Massenspektrometersäulen analysiert (HILIC- und RPLC-Trennung sowohl im positiven als auch im negativen Ionisationsmodus).
MetID und unsere MS/MS-Daten werden verwendet, um 12740 Metaboliten mit Konfidenzniveaus von 1 bis 3 zu identifizieren, wobei 1 MS/MS, Retentionszeit und m/z von Standards auf unserer Plattform entspricht, 2 MS/MS und m/z aufweist stimmt mit einer Datenbank überein und 3 stimmt mit dem m/z einer Datenbank überein.
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3 Jahre
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Umfassendes Zytokinprofil während einer präbiotischen Intervention
Zeitfenster: 3 Jahre
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Änderungen im Zytokinprofil des Wirts (Mensch) während des präbiotischen Eingriffs werden bestimmt.
Zytokine werden mithilfe eines Luminex xMAP-Zytokin-Profiling-Systems im Stanford Human Immune Monitoring Center profiliert.
Dabei werden für Zytokine spezifische Antikörper mithilfe eines Fängermoleküls an Perlen gebunden.
Die fluoreszierenden Moleküle werden an die Zytokine gebunden und die Fluoreszenz wird als Maß für die Zytokinhäufigkeit verwendet.
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3 Jahre
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
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Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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